More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2660 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  100 
 
 		 245 aa  488  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  75 
 
 		 348 aa  313  1.9999999999999998e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  56.58 
 
 		 199 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  58.99 
 
 		 288 aa  181  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  63.28 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  65.29 
 
 		 326 aa  171  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  48.92 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  58.59 
 
 		 339 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  57.81 
 
 		 339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  57.81 
 
 		 340 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  57.03 
 
 		 340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  57.03 
 
 		 340 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  56.15 
 
 		 332 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  52.45 
 
 		 311 aa  150  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  52.45 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  52.34 
 
 		 334 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  51.54 
 
 		 340 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  42.6 
 
 		 360 aa  141  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  42.6 
 
 		 360 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  42.6 
 
 		 360 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  47.65 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  42.27 
 
 		 351 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  40.54 
 
 		 348 aa  137  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  50.78 
 
 		 458 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  49.62 
 
 		 251 aa  129  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  47.22 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  48.46 
 
 		 406 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  44.03 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  47.06 
 
 		 346 aa  121  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  47.93 
 
 		 271 aa  116  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  43.24 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  48.54 
 
 		 727 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  48.54 
 
 		 727 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  41.88 
 
 		 751 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  37.84 
 
 		 198 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  41.88 
 
 		 754 aa  99.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  42.02 
 
 		 452 aa  98.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  37.16 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  44.83 
 
 		 236 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  40.32 
 
 		 360 aa  96.3  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.75 
 
 		 349 aa  95.5  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  35.82 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  39.67 
 
 		 333 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.87 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  40.34 
 
 		 358 aa  94.4  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 590 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  36.88 
 
 		 270 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  38.76 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  43.2 
 
 		 238 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  34.08 
 
 		 824 aa  93.2  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  43.2 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  41.44 
 
 		 491 aa  93.2  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  43.2 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  42.98 
 
 		 283 aa  90.5  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  30.58 
 
 		 274 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  35.29 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  34.48 
 
 		 457 aa  89.7  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  40.98 
 
 		 352 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  36.36 
 
 		 282 aa  89.4  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  35.98 
 
 		 223 aa  89  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  43.1 
 
 		 237 aa  89  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  43.7 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  35.48 
 
 		 291 aa  88.6  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.13 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.13 
 
 		 447 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.2 
 
 		 301 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  40.16 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  40.15 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  40.52 
 
 		 294 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  40.8 
 
 		 300 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  40.52 
 
 		 291 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  39.32 
 
 		 446 aa  87  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  38.1 
 
 		 524 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.66 
 
 		 292 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  36.99 
 
 		 283 aa  86.7  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.98 
 
 		 527 aa  86.3  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  38.52 
 
 		 367 aa  86.3  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  38.56 
 
 		 455 aa  85.9  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  34.36 
 
 		 453 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  41.27 
 
 		 298 aa  85.9  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  45.95 
 
 		 192 aa  85.5  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  42.86 
 
 		 383 aa  85.1  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  36.55 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  34.36 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  40.16 
 
 		 299 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  38.17 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  38.17 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  45.63 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2137  Peptidase M23  37.8 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000635965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2579  peptidase M23B  38.71 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  33.54 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  38.13 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4026  peptidase M23B  39.2 
 
 		 539 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.435878  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  41.35 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  38.84 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  39.68 
 
 		 247 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  38.14 
 
 		 419 aa  83.2  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  35.19 
 
 		 442 aa  83.2  0.000000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  36.6 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>