More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2623 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  100 
 
 		 311 aa  615  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  53.01 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  53.01 
 
 		 311 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  47.8 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  51.15 
 
 		 199 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  47.65 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  53.57 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  53.57 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  56.1 
 
 		 339 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.38 
 
 		 326 aa  138  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  55.56 
 
 		 340 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  55.37 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  53.28 
 
 		 348 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  52.03 
 
 		 332 aa  133  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  52.8 
 
 		 235 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  53.39 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  52.03 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  52.03 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  52.03 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  49.6 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  52.07 
 
 		 348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  51.22 
 
 		 351 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  47.33 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  45.97 
 
 		 224 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  47.66 
 
 		 458 aa  112  8.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  45.38 
 
 		 406 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  49.56 
 
 		 346 aa  108  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  46.09 
 
 		 251 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  44.26 
 
 		 198 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  44.26 
 
 		 198 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  51.2 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  44.03 
 
 		 452 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  41.41 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  43.9 
 
 		 727 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  45.9 
 
 		 358 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  43.9 
 
 		 727 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45 
 
 		 754 aa  102  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  44 
 
 		 284 aa  99.8  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  45.38 
 
 		 349 aa  99.8  5e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  43.7 
 
 		 751 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  44.36 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  42.4 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  36.31 
 
 		 195 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  33.52 
 
 		 282 aa  95.1  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.37 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  41.13 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  43.9 
 
 		 524 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  45.16 
 
 		 269 aa  92.8  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  42.19 
 
 		 284 aa  92.4  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  39.34 
 
 		 590 aa  92  1e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  44.83 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  41.8 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  38.71 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  40.83 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  38.69 
 
 		 824 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  43.4 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  36.2 
 
 		 788 aa  90.1  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  43.33 
 
 		 511 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  43.4 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.62 
 
 		 367 aa  89.4  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  40.18 
 
 		 491 aa  89  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  42.45 
 
 		 292 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  36 
 
 		 291 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  43.33 
 
 		 299 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  38.19 
 
 		 243 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  41.54 
 
 		 379 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  38.24 
 
 		 419 aa  85.9  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  40 
 
 		 273 aa  85.5  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  38.21 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  39.53 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  34.36 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  36.05 
 
 		 297 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  43.7 
 
 		 656 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  42.86 
 
 		 314 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0676  peptidase M23B  36.97 
 
 		 285 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.208838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  43.24 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  36.92 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  38.21 
 
 		 236 aa  85.1  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  37.4 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  38.21 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  34.73 
 
 		 376 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  38.98 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  36.92 
 
 		 447 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  38.66 
 
 		 328 aa  84.3  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  38.28 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  40.94 
 
 		 374 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  43.1 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  39.53 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  37.16 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3863  peptidase M23B  38.66 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.826682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  41.67 
 
 		 402 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  39.02 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.21 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  38.58 
 
 		 527 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  41.46 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  31.33 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  37.69 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  40 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  36.36 
 
 		 450 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  38.89 
 
 		 441 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>