More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4365 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  861    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  96.54 
 
 
433 aa  773    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  77.54 
 
 
424 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  71.84 
 
 
456 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  71.6 
 
 
456 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  71.6 
 
 
456 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  79.46 
 
 
424 aa  551  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  70.27 
 
 
444 aa  545  1e-154  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  66.25 
 
 
419 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  66.25 
 
 
419 aa  508  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  66.25 
 
 
427 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  66.25 
 
 
427 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  66.5 
 
 
419 aa  509  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  66.25 
 
 
419 aa  508  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  66.25 
 
 
427 aa  508  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  66.25 
 
 
419 aa  508  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  67.74 
 
 
427 aa  504  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  67.49 
 
 
427 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  66 
 
 
427 aa  504  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  66.75 
 
 
427 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  67.74 
 
 
427 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  67.74 
 
 
427 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  67.74 
 
 
427 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  46.67 
 
 
405 aa  289  7e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  40.35 
 
 
410 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  35.94 
 
 
377 aa  249  5e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  36.95 
 
 
378 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  36.03 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  35.82 
 
 
411 aa  242  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  36.29 
 
 
362 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  36.05 
 
 
377 aa  242  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  36.23 
 
 
378 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  36.86 
 
 
377 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  36.03 
 
 
362 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  36.29 
 
 
362 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  35.43 
 
 
361 aa  238  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  35.06 
 
 
381 aa  237  3e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  33.83 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  33.83 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  36.6 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  35.98 
 
 
382 aa  231  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  35.31 
 
 
382 aa  230  3e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  37.88 
 
 
363 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  35.89 
 
 
379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  34.15 
 
 
377 aa  224  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  35.06 
 
 
375 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  34.91 
 
 
416 aa  219  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  33.58 
 
 
387 aa  218  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  33.41 
 
 
434 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.92 
 
 
428 aa  205  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  33.58 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  34.62 
 
 
420 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  33.09 
 
 
438 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  30.95 
 
 
440 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  30.28 
 
 
441 aa  189  9e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  32.6 
 
 
438 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  32.93 
 
 
438 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  32.49 
 
 
412 aa  179  8e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  32.14 
 
 
426 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  28.08 
 
 
374 aa  173  5.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.55 
 
 
381 aa  172  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.42 
 
 
405 aa  170  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  30.98 
 
 
417 aa  170  5e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.24 
 
 
413 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.25 
 
 
366 aa  168  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  30.36 
 
 
432 aa  167  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  26.57 
 
 
477 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  26.93 
 
 
369 aa  163  7e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.33 
 
 
411 aa  162  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  30.89 
 
 
398 aa  161  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  26.98 
 
 
382 aa  156  8e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  27.64 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  28 
 
 
380 aa  154  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  29.72 
 
 
405 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  30.02 
 
 
436 aa  146  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  30.26 
 
 
436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.47 
 
 
397 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.88 
 
 
391 aa  145  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  25.9 
 
 
387 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  26.82 
 
 
379 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.47 
 
 
397 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.15 
 
 
398 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.1 
 
 
404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.21 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  47.15 
 
 
481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25.12 
 
 
396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.17 
 
 
376 aa  122  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  53.06 
 
 
117 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  25.63 
 
 
394 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  24.7 
 
 
375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  27.43 
 
 
397 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.97 
 
 
379 aa  110  7.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  25.06 
 
 
388 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.19 
 
 
402 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  23.66 
 
 
441 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  25.81 
 
 
404 aa  107  6e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  42.97 
 
 
472 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  42.97 
 
 
472 aa  103  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  26.41 
 
 
394 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  26.26 
 
 
400 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>