More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_4142 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  99.34 
 
 		 456 aa  906    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  910    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  99.34 
 
 		 456 aa  907    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  71.6 
 
 		 433 aa  578  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  71.93 
 
 		 444 aa  578  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  71.12 
 
 		 433 aa  547  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  66.83 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  64.83 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  65.07 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  65.07 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  64.83 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  62.92 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  62.92 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  62.92 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  62.92 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  62.92 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  62.92 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  62.92 
 
 		 419 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  62.92 
 
 		 427 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  62.68 
 
 		 427 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  62.92 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  65.07 
 
 		 427 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  68.27 
 
 		 424 aa  479  1e-134  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  39.95 
 
 		 410 aa  269  5.9999999999999995e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  45.18 
 
 		 405 aa  269  7e-71  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  35.66 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  36.99 
 
 		 378 aa  248  2e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  35.07 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  35.07 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  36.48 
 
 		 344 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  34.81 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  34.98 
 
 		 362 aa  237  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  35.06 
 
 		 362 aa  237  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  35.35 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  34.81 
 
 		 362 aa  233  6e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  34.94 
 
 		 377 aa  230  4e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  36.55 
 
 		 363 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  34.3 
 
 		 381 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  33.66 
 
 		 411 aa  226  8e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  33.25 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  34.13 
 
 		 378 aa  223  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  34.22 
 
 		 379 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  34.41 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  35.37 
 
 		 382 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  34.83 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  35.12 
 
 		 377 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  32.78 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  34.72 
 
 		 375 aa  212  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  31.59 
 
 		 434 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  31.41 
 
 		 428 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  33.09 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  32.7 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  30.21 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  30.21 
 
 		 438 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  30.21 
 
 		 438 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  32.77 
 
 		 381 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  30.96 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  30.38 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  29.74 
 
 		 441 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  34.58 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  32.85 
 
 		 366 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  29.87 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  31.72 
 
 		 426 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  28.83 
 
 		 413 aa  168  2e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  33.96 
 
 		 417 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  28.83 
 
 		 369 aa  167  5e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.63 
 
 		 405 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  31.53 
 
 		 436 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  31.69 
 
 		 436 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  27.97 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  30.66 
 
 		 411 aa  157  3e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  27.25 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  27.75 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  28.94 
 
 		 379 aa  156  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  30.37 
 
 		 398 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  26.95 
 
 		 374 aa  156  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  27.94 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  28.28 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  29.72 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.81 
 
 		 391 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  26.32 
 
 		 396 aa  133  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.11 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  25.62 
 
 		 398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  45.53 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  52.73 
 
 		 117 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.25 
 
 		 379 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  28.71 
 
 		 397 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.96 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  26.35 
 
 		 394 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.36 
 
 		 374 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  24.88 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  27.55 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.5 
 
 		 394 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  42.74 
 
 		 301 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  26.02 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  24.23 
 
 		 402 aa  103  8e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  39.06 
 
 		 452 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  42.37 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  42.37 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>