More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4084 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  866    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  96.54 
 
 		 433 aa  803    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  78.26 
 
 		 424 aa  618  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  71.36 
 
 		 456 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  71.12 
 
 		 456 aa  578  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  71.12 
 
 		 456 aa  577  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  79.22 
 
 		 424 aa  545  1e-154  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  69.59 
 
 		 444 aa  540  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  66.42 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  66.42 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  66.42 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  66.67 
 
 		 419 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  66.42 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  66.42 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  66.17 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  67.66 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  66.42 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  66.42 
 
 		 419 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  67.66 
 
 		 427 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  67.66 
 
 		 427 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  66.67 
 
 		 427 aa  498  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  67.41 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  67.66 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  46.91 
 
 		 405 aa  290  5.0000000000000004e-77  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  40.4 
 
 		 410 aa  265  8e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  36.43 
 
 		 377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  37.1 
 
 		 377 aa  248  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  36.79 
 
 		 378 aa  247  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  36.55 
 
 		 362 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  35.01 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  36.79 
 
 		 377 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  36.81 
 
 		 362 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  36.47 
 
 		 378 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  36.55 
 
 		 362 aa  243  5e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  36.18 
 
 		 361 aa  243  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  36.81 
 
 		 362 aa  242  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  36.3 
 
 		 381 aa  240  5e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  34.83 
 
 		 377 aa  239  9e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  34.83 
 
 		 377 aa  239  9e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  36.34 
 
 		 344 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  36.47 
 
 		 382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  36.98 
 
 		 382 aa  232  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  34.89 
 
 		 377 aa  227  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  37.37 
 
 		 363 aa  227  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  36.98 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  35.15 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  35.43 
 
 		 416 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  33.33 
 
 		 387 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  34.03 
 
 		 434 aa  217  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  34.31 
 
 		 428 aa  202  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  33.08 
 
 		 428 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  34.83 
 
 		 420 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  33.25 
 
 		 438 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  32.78 
 
 		 438 aa  192  9e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  31.19 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  31.31 
 
 		 441 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.02 
 
 		 438 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  32.99 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  32.02 
 
 		 426 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  31.46 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  29.1 
 
 		 413 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  27.65 
 
 		 374 aa  174  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  31.55 
 
 		 381 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  31.38 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  27.86 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  32.72 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  27.84 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29 
 
 		 366 aa  167  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  31.39 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  33.65 
 
 		 411 aa  164  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 382 aa  156  6e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  28.98 
 
 		 380 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  29.31 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  30.26 
 
 		 436 aa  150  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  29.69 
 
 		 405 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  30.02 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  26.38 
 
 		 387 aa  147  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  27.08 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  26.81 
 
 		 397 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.81 
 
 		 391 aa  143  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  26.72 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.56 
 
 		 404 aa  137  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  28.17 
 
 		 398 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.55 
 
 		 374 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  25.42 
 
 		 396 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.63 
 
 		 376 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  46.34 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27 
 
 		 394 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  54.08 
 
 		 117 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  28.12 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  24.33 
 
 		 441 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.18 
 
 		 375 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  25.59 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  25.45 
 
 		 402 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  25.43 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  26.27 
 
 		 404 aa  107  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.09 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  32.94 
 
 		 404 aa  103  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0525  M23/M37 peptidase domain protein  43.75 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0683  Peptidase M23  43.75 
 
 		 472 aa  103  6e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00295587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>