More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0042 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  91.71 
 
 		 377 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  99.17 
 
 		 362 aa  727    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  98.9 
 
 		 362 aa  726    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  91.99 
 
 		 377 aa  674    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  100 
 
 		 362 aa  733    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  91.99 
 
 		 377 aa  674    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  99.17 
 
 		 362 aa  727    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  90.41 
 
 		 344 aa  632  1e-180  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  71.19 
 
 		 361 aa  535  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  68.51 
 
 		 377 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  68.23 
 
 		 378 aa  512  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  67.4 
 
 		 377 aa  509  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  67.4 
 
 		 378 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  70.44 
 
 		 377 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  64.38 
 
 		 379 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  40 
 
 		 411 aa  283  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  41.95 
 
 		 387 aa  275  8e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  44.86 
 
 		 363 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  35.75 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  37.08 
 
 		 433 aa  235  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  37.63 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  33.67 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  36.89 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  33.67 
 
 		 419 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  36.29 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  230  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  33.42 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  33.42 
 
 		 419 aa  229  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  229  6e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  35.77 
 
 		 424 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  33.42 
 
 		 419 aa  228  9e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  33.92 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  33.92 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  33.92 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  33.92 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  33.99 
 
 		 405 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  34.18 
 
 		 427 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  34.81 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  35.06 
 
 		 456 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  37.46 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  33.67 
 
 		 428 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  33.42 
 
 		 416 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  34.81 
 
 		 456 aa  225  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  35.31 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  36.57 
 
 		 382 aa  222  9e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  35.16 
 
 		 444 aa  220  3e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  33.01 
 
 		 441 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  33.92 
 
 		 427 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  33.09 
 
 		 440 aa  216  4e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  35.17 
 
 		 438 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  32.84 
 
 		 434 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  33.25 
 
 		 438 aa  215  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  33.25 
 
 		 438 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  36.89 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  33.15 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  32.88 
 
 		 369 aa  209  7e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  32.65 
 
 		 420 aa  205  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  33.42 
 
 		 381 aa  204  2e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  35.14 
 
 		 424 aa  203  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 382 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  30.96 
 
 		 398 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  29.23 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  29.8 
 
 		 412 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  29.01 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  30.88 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  29.81 
 
 		 405 aa  179  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  29.05 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  29.16 
 
 		 436 aa  171  2e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  29.55 
 
 		 379 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  28.84 
 
 		 380 aa  165  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  28.84 
 
 		 380 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  47.24 
 
 		 477 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  27.27 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  28.05 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  55.75 
 
 		 117 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  41.78 
 
 		 481 aa  142  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  30.19 
 
 		 405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  27.85 
 
 		 398 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  25.27 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  27.03 
 
 		 388 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.38 
 
 		 394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  26.74 
 
 		 379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  27.07 
 
 		 397 aa  130  5.0000000000000004e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  43.8 
 
 		 432 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  38.64 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  29.1 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  25.59 
 
 		 397 aa  119  9e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  26 
 
 		 374 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  25.93 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  28.49 
 
 		 374 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.67 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  25.75 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  27.42 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  25.95 
 
 		 377 aa  106  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.16 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  42.15 
 
 		 309 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  27.86 
 
 		 375 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  36.84 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>