More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0724 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0724  peptidase M23B  100 
 
 
379 aa  764    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  33.33 
 
 
366 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  34.67 
 
 
374 aa  223  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  34.74 
 
 
428 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  34.27 
 
 
416 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  32.49 
 
 
420 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  33.75 
 
 
428 aa  206  6e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  32.76 
 
 
434 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.29 
 
 
382 aa  199  5e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  30.87 
 
 
387 aa  199  6e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  32.04 
 
 
440 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  33.8 
 
 
405 aa  190  4e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  32.64 
 
 
378 aa  190  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0562  hypothetical protein  31.1 
 
 
380 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  30.97 
 
 
387 aa  186  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0538  hypothetical protein  30.24 
 
 
380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2569  peptidase M23B  35.71 
 
 
405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0139547 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  31.4 
 
 
377 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  28.31 
 
 
412 aa  184  3e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  31.72 
 
 
441 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  31.75 
 
 
378 aa  181  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  32.03 
 
 
369 aa  179  5.999999999999999e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  32.19 
 
 
361 aa  178  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  31.48 
 
 
413 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4392  M23/27 family peptidase  31.07 
 
 
411 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  28.69 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2534  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  29.89 
 
 
381 aa  172  9e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.286478  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  29.35 
 
 
377 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  29.35 
 
 
377 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  29.92 
 
 
398 aa  169  5e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  29.66 
 
 
362 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  29.63 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  30.26 
 
 
344 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  30.42 
 
 
362 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3610  peptidase M23B  32.06 
 
 
363 aa  166  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  30.42 
 
 
362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  30.42 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  29.48 
 
 
436 aa  164  3e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  29.77 
 
 
436 aa  162  9e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  29.74 
 
 
381 aa  162  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  27.43 
 
 
419 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3950  hypothetical protein  27.43 
 
 
419 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.50769 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  27.43 
 
 
419 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  30.75 
 
 
438 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  27.43 
 
 
419 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  27.43 
 
 
419 aa  159  9e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  27.43 
 
 
427 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  27.43 
 
 
427 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  27.43 
 
 
427 aa  159  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  27.43 
 
 
427 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.36 
 
 
424 aa  155  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  28.85 
 
 
456 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  28.85 
 
 
456 aa  151  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  28.85 
 
 
456 aa  150  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  31.02 
 
 
377 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  28.77 
 
 
379 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4820  hypothetical protein  27.1 
 
 
444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.369351  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  26.88 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.9 
 
 
426 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  27.86 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  27.86 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  27.86 
 
 
427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  27.12 
 
 
433 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  30.92 
 
 
382 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0122  hypothetical protein  26.55 
 
 
427 aa  145  1e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  27.6 
 
 
427 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  25.61 
 
 
430 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  28.97 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  28.08 
 
 
382 aa  139  7e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  42.86 
 
 
477 aa  135  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  30.23 
 
 
375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3942  hypothetical protein  26.65 
 
 
424 aa  133  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  24.12 
 
 
398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  22.64 
 
 
394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  28.61 
 
 
438 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5868  hypothetical protein  56.12 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.617711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.15 
 
 
397 aa  126  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  28.76 
 
 
388 aa  126  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  24.94 
 
 
404 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  45.74 
 
 
438 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.08 
 
 
396 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  22.41 
 
 
397 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  25.43 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1545  Peptidase M23  43.08 
 
 
481 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03546  M23 peptidase domain protein  51.04 
 
 
411 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  51.04 
 
 
432 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4030  hypothetical protein  44.66 
 
 
427 aa  109  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  24.47 
 
 
391 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3510  peptidase M23B  28.3 
 
 
397 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  24.09 
 
 
377 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  22.73 
 
 
375 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.23 
 
 
374 aa  98.6  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  22.8 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2021  Peptidase M23  40.46 
 
 
379 aa  96.3  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  32.93 
 
 
375 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0175  M23 family peptidase  40.2 
 
 
405 aa  95.1  2e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  22.62 
 
 
379 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  23.04 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  24.79 
 
 
411 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.21 
 
 
452 aa  93.6  5e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>