More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2205 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  100 
 
 
450 aa  899    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  45.01 
 
 
445 aa  298  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3297  peptidase M23B  37.47 
 
 
448 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235812  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  34.5 
 
 
446 aa  242  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  33.82 
 
 
452 aa  239  5e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  36.6 
 
 
475 aa  230  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  40.4 
 
 
482 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  35.89 
 
 
468 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  32.18 
 
 
582 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  34.84 
 
 
468 aa  200  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  46.39 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  47.56 
 
 
411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  51.16 
 
 
379 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  33.02 
 
 
404 aa  139  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  37.55 
 
 
430 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  49.28 
 
 
441 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  38.17 
 
 
402 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  53.91 
 
 
400 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  52.07 
 
 
431 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  45.68 
 
 
379 aa  134  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  49.04 
 
 
402 aa  133  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  46.15 
 
 
376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  35.96 
 
 
284 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  50.41 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  42.69 
 
 
299 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  48.72 
 
 
372 aa  130  6e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  51.64 
 
 
305 aa  129  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  43.75 
 
 
375 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  48.03 
 
 
423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  47.06 
 
 
377 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3173  peptidase M23B  33.21 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000536198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  34.06 
 
 
283 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  33.33 
 
 
419 aa  127  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  32.14 
 
 
375 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  48.82 
 
 
404 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0060  Peptidase M23  32.09 
 
 
320 aa  126  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00481353  hitchhiker  0.00293385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5846  peptidase M23B  54.7 
 
 
415 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  50.78 
 
 
824 aa  124  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  45.38 
 
 
373 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2039  Peptidase M23  56.67 
 
 
414 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0205491  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  33.22 
 
 
590 aa  124  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  54.05 
 
 
754 aa  124  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  53.45 
 
 
430 aa  124  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  39.43 
 
 
334 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1223  Peptidase M23  29.57 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  42.31 
 
 
333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  52.29 
 
 
727 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  52.29 
 
 
727 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2733  Peptidase M23  51.75 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1868  peptidase M23B  56.12 
 
 
460 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0785648  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  48.74 
 
 
751 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  47.93 
 
 
314 aa  120  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  49.18 
 
 
301 aa  120  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  48 
 
 
230 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000639661  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0061  peptidase M23B  51.72 
 
 
387 aa  120  7e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2745  putative transmembrane protein  52.89 
 
 
332 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.170207  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  32.83 
 
 
271 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  57.58 
 
 
394 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  49.18 
 
 
302 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  48.78 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  48.78 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2486  peptidase M23B  52.1 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000462301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  32.45 
 
 
271 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  50 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  52.89 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  30.97 
 
 
271 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  47.15 
 
 
305 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2447  peptidase M23B  51.75 
 
 
459 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  50 
 
 
300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6051  Peptidase M23  56.73 
 
 
382 aa  118  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.72546  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  46.88 
 
 
417 aa  117  3e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3003  peptidase M23B  50.88 
 
 
457 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.070332 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  31.46 
 
 
274 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  51.75 
 
 
455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3272  peptidase M23B  32.88 
 
 
459 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.790257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  50.88 
 
 
453 aa  117  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3157  peptidase M23B  54.9 
 
 
238 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2529  peptidase M23B  37.74 
 
 
445 aa  117  6e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.073989 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  49.12 
 
 
443 aa  116  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  49.59 
 
 
305 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1868  Peptidase M23  48.39 
 
 
398 aa  116  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0529967  normal  0.144009 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  45.24 
 
 
367 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2264  peptidase M23B  42.51 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.971907  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  59.6 
 
 
328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5408  Peptidase M23  50 
 
 
538 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252675  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  51.64 
 
 
524 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  40.13 
 
 
399 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0148  peptidase M23B  48.78 
 
 
301 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.790434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  50 
 
 
442 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  33.72 
 
 
358 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0243  M24/M37 family peptidase  46.34 
 
 
300 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  39.47 
 
 
399 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  41.61 
 
 
304 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  50.93 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  45.26 
 
 
360 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3607  peptidase M23B  40 
 
 
469 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0610326  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  55.56 
 
 
290 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  52.63 
 
 
665 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3167  Peptidase M23  46.67 
 
 
391 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  54.37 
 
 
349 aa  113  5e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>