22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5107 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  86.7 
 
 		 778 aa  1229    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  100 
 
 		 794 aa  1569    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  86.57 
 
 		 778 aa  1229    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5593  O-antigen polymerase  44.31 
 
 		 471 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  32.67 
 
 		 492 aa  183  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2667  O-antigen polymerase  36.26 
 
 		 500 aa  180  9e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3800  hypothetical protein  33.11 
 
 		 465 aa  177  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  31.89 
 
 		 430 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1049  hypothetical protein  30.08 
 
 		 279 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1984  hypothetical protein  28.69 
 
 		 417 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  25.57 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0291  O-antigen polymerase  29.95 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2658  hypothetical protein  33.62 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  26.54 
 
 		 497 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  26.54 
 
 		 497 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  26.54 
 
 		 491 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  27.85 
 
 		 480 aa  55.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  27.01 
 
 		 1066 aa  54.7  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  28.9 
 
 		 475 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  27.52 
 
 		 475 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  26.73 
 
 		 677 aa  46.2  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2908  periplasmic copper-binding  40.54 
 
 		 422 aa  43.9  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109404  normal  0.407024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>