21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5069 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  100 
 
 		 778 aa  1546    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  87.47 
 
 		 794 aa  1259    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  99.49 
 
 		 778 aa  1543    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5593  O-antigen polymerase  43.16 
 
 		 471 aa  310  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  32.29 
 
 		 492 aa  187  5e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2667  O-antigen polymerase  37.61 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3800  hypothetical protein  33.11 
 
 		 465 aa  177  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1378  hypothetical protein  32.33 
 
 		 430 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1049  hypothetical protein  31.58 
 
 		 279 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1984  hypothetical protein  32.95 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0291  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 492 aa  77.4  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2644  glycosy hydrolase family protein  26.21 
 
 		 601 aa  65.9  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2658  hypothetical protein  33.62 
 
 		 300 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  26.67 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  28.23 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  28.88 
 
 		 475 aa  55.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  27.01 
 
 		 1302 aa  45.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  25.94 
 
 		 1066 aa  44.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  24.08 
 
 		 497 aa  44.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  24.08 
 
 		 497 aa  44.7  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>