10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1703 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  100 
 
 
492 aa  988    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2667  O-antigen polymerase  37.76 
 
 
500 aa  236  6e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3800  hypothetical protein  35.88 
 
 
465 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5593  O-antigen polymerase  32.49 
 
 
471 aa  205  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  32.43 
 
 
778 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  32.21 
 
 
778 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  32.15 
 
 
794 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0291  O-antigen polymerase  28.71 
 
 
492 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.795233 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.41 
 
 
754 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  26.37 
 
 
785 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>