8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5593 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5593  O-antigen polymerase  100 
 
 		 471 aa  923    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5107  hypothetical protein  44.74 
 
 		 794 aa  319  5e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.819284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4608  hypothetical protein  43.56 
 
 		 778 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.042259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5069  hypothetical protein  43.56 
 
 		 778 aa  298  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.134968 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3800  hypothetical protein  36.76 
 
 		 465 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1703  O-antigen polymerase  32.49 
 
 		 492 aa  211  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2667  O-antigen polymerase  34.8 
 
 		 500 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0291  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 492 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>