47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0142 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  912    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5010  hypothetical protein  44.06 
 
 
628 aa  337  1.9999999999999998e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  36.32 
 
 
614 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  32.18 
 
 
503 aa  189  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  28.29 
 
 
1005 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  27.86 
 
 
515 aa  136  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  26.89 
 
 
559 aa  131  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  30.24 
 
 
556 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.61 
 
 
546 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  25.65 
 
 
506 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  26.8 
 
 
547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8054  hypothetical protein  26.27 
 
 
528 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  27.7 
 
 
522 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  24.64 
 
 
542 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  24.34 
 
 
509 aa  95.5  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  27.6 
 
 
514 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5668  hypothetical protein  26.42 
 
 
458 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0387756  normal  0.0490579 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2206  hypothetical protein  27.3 
 
 
565 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.855212  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4474  hypothetical protein  26.98 
 
 
569 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805357  normal  0.305115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6496  hypothetical protein  26.05 
 
 
1051 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2496  hypothetical protein  27.14 
 
 
1589 aa  86.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.839267  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  26.53 
 
 
1781 aa  84.7  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  26.64 
 
 
1752 aa  83.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  25.66 
 
 
1785 aa  82.8  0.00000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  25.66 
 
 
2135 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  24 
 
 
1627 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  26.57 
 
 
1838 aa  77.4  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  26.48 
 
 
541 aa  76.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  26.51 
 
 
552 aa  75.9  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6412  outer membrane adhesin like proteiin  26.33 
 
 
2337 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5667  hypothetical protein  23.93 
 
 
584 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438933  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  26.64 
 
 
1728 aa  70.1  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  24.17 
 
 
1389 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0606  hypothetical protein  25.33 
 
 
553 aa  65.1  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.617667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  26.18 
 
 
1282 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  26.67 
 
 
757 aa  63.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  23.74 
 
 
1744 aa  60.8  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  23.86 
 
 
753 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.44 
 
 
765 aa  57.4  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  26.32 
 
 
773 aa  56.2  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.84 
 
 
772 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  26.89 
 
 
777 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  24.03 
 
 
670 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  27.52 
 
 
753 aa  46.6  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  26.54 
 
 
765 aa  44.7  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  22.74 
 
 
717 aa  43.9  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  28.95 
 
 
757 aa  43.1  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>