41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1318 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  100 
 
 		 648 aa  1244    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  55.16 
 
 		 663 aa  485  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  40.23 
 
 		 651 aa  316  7e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  40.14 
 
 		 656 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  31.62 
 
 		 595 aa  158  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  31.61 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  30.24 
 
 		 482 aa  108  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2345  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  31.89 
 
 		 1590 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  38.17 
 
 		 412 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2155  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  30.34 
 
 		 1686 aa  95.1  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2679  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  35.55 
 
 		 1627 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000064285 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0987  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  33.33 
 
 		 1669 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2743  cytoplasmic membrane protein  29.97 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000491523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  31.86 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3909  hypothetical protein  40 
 
 		 1838 aa  84  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  34.41 
 
 		 526 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  39.1 
 
 		 678 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.73 
 
 		 2002 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  49.46 
 
 		 892 aa  77  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  28.72 
 
 		 1762 aa  73.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  32.63 
 
 		 4761 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  32.95 
 
 		 1700 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1183 aa  72  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  39.72 
 
 		 739 aa  70.9  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  30.7 
 
 		 810 aa  68.6  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  28.18 
 
 		 1748 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  27.19 
 
 		 2002 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  29.09 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  32.85 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  32.61 
 
 		 693 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  37.23 
 
 		 631 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  38.17 
 
 		 374 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  32.31 
 
 		 398 aa  54.7  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  34.53 
 
 		 978 aa  54.3  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  43.27 
 
 		 1026 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.76 
 
 		 2195 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  42.35 
 
 		 635 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  32.48 
 
 		 1282 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1735  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1627 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.970827  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  28.18 
 
 		 2191 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  29.91 
 
 		 692 aa  44.7  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>