23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3142 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  784    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  54.13 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  53.85 
 
 
678 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  52.6 
 
 
631 aa  160  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  44.71 
 
 
739 aa  143  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  41.55 
 
 
1183 aa  129  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  36.69 
 
 
410 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  42.66 
 
 
1700 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  38.91 
 
 
810 aa  123  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  38.07 
 
 
258 aa  116  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  37.13 
 
 
486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  38.46 
 
 
526 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  36.32 
 
 
482 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  35.48 
 
 
368 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  31.84 
 
 
892 aa  97.4  4e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  38.97 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  37.65 
 
 
663 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  37.77 
 
 
648 aa  92.8  9e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  33.33 
 
 
595 aa  90.5  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2847  hypothetical protein  36.41 
 
 
448 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00493413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  34.6 
 
 
656 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  34.8 
 
 
651 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.910785 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1859  UDP-glucose pyrophosphorylase  31.21 
 
 
295 aa  43.5  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>