21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2850 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2850  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  513  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1017  Ig-like, group 2  54.67 
 
 		 486 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1914  hypothetical protein  54.11 
 
 		 595 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1915  hypothetical protein  53.39 
 
 		 482 aa  205  5e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0232  antifreeze-related protein  48.42 
 
 		 368 aa  195  7e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.420023  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  46.52 
 
 		 526 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1491  hypothetical protein  46.64 
 
 		 1183 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.142763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0198  periplasmic copper-binding  45.74 
 
 		 810 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.212278  normal  0.0186793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0311  hypothetical protein  41.25 
 
 		 410 aa  160  3e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1480  hypothetical protein  43.12 
 
 		 1700 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3142  hypothetical protein  37.61 
 
 		 412 aa  115  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.611443  normal  0.885698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  33.91 
 
 		 678 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05680  hypothetical protein  36.53 
 
 		 374 aa  97.8  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.319734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  34.41 
 
 		 892 aa  91.3  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3132  hypothetical protein  38.73 
 
 		 739 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.756366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6489  hypothetical protein  36.32 
 
 		 631 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  28.9 
 
 		 398 aa  66.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2254  hypothetical protein  35.26 
 
 		 663 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.017887  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1318  hypothetical protein  34.78 
 
 		 648 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.181823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2483  hypothetical protein  35.14 
 
 		 656 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1298  hypothetical protein  33.78 
 
 		 651 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.910785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>