35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4130 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4130  putative N,N-dimethylformamidase  100 
 
 
765 aa  1553    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.616423  normal  0.183627 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1673  large subunit of N,N-dimethylformamidase  38.73 
 
 
753 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2052  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.19 
 
 
772 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7060  large subunit of N,N-dimethylformamidase  36.13 
 
 
757 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0158  putative N,N-dimethylformamidase  33.93 
 
 
777 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00321261 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1952  putative N,N-dimethylformamidase  34.83 
 
 
773 aa  419  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1283  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.54 
 
 
810 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.563872  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1500  large subunit of N,N-dimethylformamidase  33.33 
 
 
810 aa  397  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200326  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4257  large subunit of N,N-dimethylformamidase  34.11 
 
 
757 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4361  hypothetical protein  34.75 
 
 
753 aa  356  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.372541  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1672  hypothetical protein  33.86 
 
 
717 aa  337  7e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0496  large subunit of N,N-dimethylformamidase  35.67 
 
 
765 aa  322  1.9999999999999998e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.323817 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0708  hypothetical protein  33.38 
 
 
705 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165504  hitchhiker  0.00374687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0711  hypothetical protein  30.73 
 
 
691 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000978067 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5002  hypothetical protein  32.63 
 
 
670 aa  203  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0778  hypothetical protein  25.93 
 
 
506 aa  80.1  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2950  hypothetical protein  30.63 
 
 
541 aa  73.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  normal  0.112272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2682  hypothetical protein  24 
 
 
556 aa  69.7  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000374994  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3100  hypothetical protein  23.53 
 
 
503 aa  62.4  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.444096  normal  0.156849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0843  hypothetical protein  23.81 
 
 
515 aa  62.4  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1756  Fibronectin type III domain protein  26.41 
 
 
2135 aa  61.6  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.527885 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5117  Ig domain protein group 1 domain protein  23.51 
 
 
1005 aa  60.8  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0644734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7053  hypothetical protein  24.46 
 
 
514 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0701  hypothetical protein  20.81 
 
 
509 aa  55.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3678  cadherin  24.71 
 
 
1389 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.210841 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2197  hypothetical protein  22.12 
 
 
614 aa  52  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.442542  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8496  hypothetical protein  28.12 
 
 
1282 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200313  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0342  hypothetical protein  23.54 
 
 
522 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2852  hypothetical protein  24.62 
 
 
546 aa  48.5  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.348176  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0333  hypothetical protein  22.17 
 
 
542 aa  47.8  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.983717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1933  hypothetical protein  24.39 
 
 
1785 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0142  hypothetical protein  26.54 
 
 
448 aa  45.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3633  hypothetical protein  22.29 
 
 
547 aa  44.3  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.584822 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1109  hypothetical protein  25.16 
 
 
559 aa  43.9  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0904  hypothetical protein  22.94 
 
 
552 aa  44.3  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0366726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>