99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2624 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4245  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.01 
 
 
1072 aa  745    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2624  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  100 
 
 
950 aa  1933    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.3089  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3432  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.16 
 
 
964 aa  840    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0164906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1610  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.91 
 
 
964 aa  873    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0417  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.61 
 
 
905 aa  145  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.46141  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0009  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.8 
 
 
684 aa  134  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1023  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  37.86 
 
 
636 aa  127  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  32.57 
 
 
654 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0099  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  33.12 
 
 
552 aa  123  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  35.59 
 
 
541 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.14 
 
 
879 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.38 
 
 
959 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3174  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.82 
 
 
694 aa  112  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.15405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  33.06 
 
 
539 aa  112  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0196  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.92 
 
 
502 aa  109  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2558  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.7 
 
 
728 aa  107  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.39914  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0455  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  36.73 
 
 
357 aa  107  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  28.83 
 
 
928 aa  107  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  34.12 
 
 
539 aa  104  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0270  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.89 
 
 
364 aa  103  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5070  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  35.87 
 
 
353 aa  103  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212369  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  34.01 
 
 
370 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3789  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
591 aa  103  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.89 
 
 
387 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.123006  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  31.67 
 
 
537 aa  102  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  31.67 
 
 
537 aa  102  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2561  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  28.24 
 
 
784 aa  101  5e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  31.67 
 
 
537 aa  102  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.77 
 
 
794 aa  96.3  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.469744  normal  0.0598623 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20080  LysM domain-containing protein  31.84 
 
 
695 aa  94.7  6e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2816  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.3 
 
 
542 aa  92.4  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1539  twin-arginine translocation pathway signal  35.07 
 
 
486 aa  90.5  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.407284  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3434  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.53 
 
 
366 aa  90.9  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0021339  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4840  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  31.19 
 
 
277 aa  88.6  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2719  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  32.59 
 
 
274 aa  79.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.670474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2393  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.77 
 
 
268 aa  78.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.594471  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1925  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase  32.26 
 
 
289 aa  78.6  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0536095  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0641  hypothetical protein  32.91 
 
 
449 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3940  hypothetical protein  34.53 
 
 
514 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.405869  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3312  hypothetical protein  34.04 
 
 
445 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.223061  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2152  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.48 
 
 
356 aa  73.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000936807  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5193  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.73 
 
 
356 aa  71.6  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000362844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1930  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.94 
 
 
223 aa  71.2  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4626  peptidase M23B  30.97 
 
 
592 aa  70.5  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163104 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1928  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  25.59 
 
 
391 aa  70.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35340  negative regulator of beta-lactamase expression  28.82 
 
 
311 aa  70.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3053  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.8 
 
 
792 aa  70.1  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0646042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1763  Peptidase M23  31.85 
 
 
599 aa  68.2  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.12 
 
 
157 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2671  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  27.78 
 
 
792 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342561  normal  0.283165 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0050  hypothetical protein  28.64 
 
 
446 aa  67.8  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359798  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3616  hypothetical protein  29.17 
 
 
582 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.056741  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1929  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  28.12 
 
 
223 aa  64.3  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1972  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29.25 
 
 
220 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.289767  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0038  peptidase M23B  31.21 
 
 
597 aa  64.3  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3323  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.88 
 
 
150 aa  63.2  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0947828  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  30.77 
 
 
273 aa  62  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3666  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, putative  29.88 
 
 
150 aa  61.6  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2680  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  39.08 
 
 
1206 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.117789 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1572  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.27 
 
 
150 aa  61.6  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.577314  normal  0.236623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3745  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.27 
 
 
150 aa  61.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3340  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.18 
 
 
152 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  29 
 
 
799 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00111453  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3670  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.66 
 
 
152 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0492519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3648  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.88 
 
 
150 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3389  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.59 
 
 
152 aa  59.3  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0561834  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3698  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 
150 aa  58.9  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 
150 aa  58.9  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5704  PA14 domain protein  35.87 
 
 
423 aa  56.2  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  37.89 
 
 
4009 aa  56.2  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  36.36 
 
 
918 aa  56.2  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3703  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  37.89 
 
 
4022 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000991592 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16840  hypothetical protein  25.68 
 
 
266 aa  55.8  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.754207  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0383  PA14 domain protein  33.33 
 
 
578 aa  54.3  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0135238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4349  Glycosyl hydrolase family 98 putative carbohydrate binding module  35.14 
 
 
1236 aa  54.3  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.165187 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0545  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.46 
 
 
157 aa  52  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0529  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase, putative  32.46 
 
 
222 aa  52  0.00005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.549299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4585  hypothetical protein  30.77 
 
 
1414 aa  52  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4473  peptidase M23B  28.48 
 
 
630 aa  51.6  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0521  PA14 domain protein  29.51 
 
 
841 aa  51.6  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.387199  hitchhiker  0.000185661 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1669  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.66 
 
 
173 aa  51.6  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.761458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6270  hypothetical protein  35.71 
 
 
213 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958843  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1915  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.36 
 
 
790 aa  50.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1789  hypothetical protein  28.87 
 
 
1123 aa  50.8  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  41.18 
 
 
558 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  32.94 
 
 
1351 aa  48.9  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  33.03 
 
 
1504 aa  48.9  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1581  PA14 domain protein  32.89 
 
 
969 aa  48.1  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0674  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.43 
 
 
766 aa  48.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0154  hypothetical protein  30.67 
 
 
401 aa  47.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2778  PA14 domain protein  29.03 
 
 
978 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2448  PA14 domain protein  36.78 
 
 
1141 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  35 
 
 
569 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2774  peptidase M23B  42.86 
 
 
571 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1884  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
907 aa  45.4  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  37.5 
 
 
2252 aa  45.1  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33340  hypothetical protein  31.19 
 
 
1414 aa  45.1  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.774424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5274  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase negative regulator of AmpC, AmpD  26.2 
 
 
224 aa  44.7  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3182  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  24.19 
 
 
375 aa  44.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00209082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>