30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2884 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  100 
 
 		 1017 aa  2063    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  45.63 
 
 		 848 aa  612  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  34.67 
 
 		 1024 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.9 
 
 		 696 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0919  PKD domain-containing protein  21.94 
 
 		 1023 aa  92.8  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  38.56 
 
 		 1482 aa  88.2  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1314 aa  87.4  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3228  cytochrome c family protein  26.7 
 
 		 991 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  35.71 
 
 		 646 aa  78.2  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  27.35 
 
 		 2004 aa  75.9  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3106  PKD domain containing protein  25.71 
 
 		 989 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  30.73 
 
 		 873 aa  71.6  0.00000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  34.74 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0424  cytochrome c family protein  24.8 
 
 		 917 aa  67.4  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  27.38 
 
 		 746 aa  66.6  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.75 
 
 		 1189 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0921  hypothetical protein  29.2 
 
 		 1160 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  32.39 
 
 		 717 aa  58.9  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 2082 aa  58.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  34.62 
 
 		 1321 aa  55.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.87 
 
 		 1814 aa  54.7  0.000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3233  cytochrome c family protein  25.86 
 
 		 1067 aa  54.3  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0173325  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  45.45 
 
 		 518 aa  53.5  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2598  hypothetical protein  27.19 
 
 		 369 aa  51.2  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  35.71 
 
 		 679 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3102  PKD domain containing protein  25.22 
 
 		 1132 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  23.5 
 
 		 425 aa  48.9  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  48.48 
 
 		 524 aa  48.9  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  30.82 
 
 		 1390 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  39.74 
 
 		 607 aa  45.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>