53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0241 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0241  tetratricopeptide repeat domain protein  100 
 
 
668 aa  1333    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.113606  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2296  hypothetical protein  27.33 
 
 
684 aa  251  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.26 
 
 
700 aa  128  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.55 
 
 
668 aa  81.3  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  31.72 
 
 
391 aa  73.6  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  32.47 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  36.97 
 
 
373 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  30.11 
 
 
396 aa  64.7  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  29.93 
 
 
522 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  29.45 
 
 
384 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.61 
 
 
379 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  30.88 
 
 
676 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  30.14 
 
 
930 aa  59.3  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  34.91 
 
 
525 aa  58.9  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
930 aa  58.5  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  30.18 
 
 
395 aa  58.5  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  30.25 
 
 
1177 aa  58.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  30.77 
 
 
372 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  28.74 
 
 
436 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.89 
 
 
346 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  30.88 
 
 
412 aa  56.2  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 
363 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30.11 
 
 
709 aa  56.2  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.35 
 
 
343 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.72 
 
 
831 aa  55.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.33 
 
 
347 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 
355 aa  54.7  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  31.9 
 
 
392 aa  53.5  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  24.71 
 
 
418 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 
368 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  30.25 
 
 
1146 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  32.97 
 
 
579 aa  52  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  27.22 
 
 
1030 aa  51.2  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  34.91 
 
 
360 aa  51.2  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  28.57 
 
 
639 aa  51.2  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 
361 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  27.8 
 
 
319 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.03 
 
 
343 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.15 
 
 
1293 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  22.48 
 
 
1163 aa  49.7  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  22.56 
 
 
899 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  31.82 
 
 
627 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.5 
 
 
355 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  27.85 
 
 
903 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.1 
 
 
752 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  32.89 
 
 
1068 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.27 
 
 
365 aa  47.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  23.56 
 
 
386 aa  46.2  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  35.06 
 
 
390 aa  45.4  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  28.28 
 
 
387 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  26.14 
 
 
880 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 
307 aa  44.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25.55 
 
 
642 aa  43.9  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>