124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1132 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  668    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  61.68 
 
 		 322 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  61.13 
 
 		 318 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  59.94 
 
 		 321 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  55.94 
 
 		 326 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  57.91 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  38.55 
 
 		 318 aa  182  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  37.02 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  31.87 
 
 		 668 aa  133  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  32.4 
 
 		 831 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.86 
 
 		 346 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  31.72 
 
 		 930 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  29.32 
 
 		 353 aa  113  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  26.81 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 		 211 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  29.58 
 
 		 676 aa  108  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  30.22 
 
 		 522 aa  105  8e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  32.32 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  27.83 
 
 		 579 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.3 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  30.06 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  33.72 
 
 		 752 aa  99.8  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  27.81 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.69 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.86 
 
 		 588 aa  96.3  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.57 
 
 		 392 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  26.86 
 
 		 387 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 627 aa  93.6  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  31.55 
 
 		 709 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.57 
 
 		 1293 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.69 
 
 		 372 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  25.72 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  27.73 
 
 		 377 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  34.5 
 
 		 391 aa  87.8  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  30.86 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  37.35 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  32.99 
 
 		 1030 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.29 
 
 		 1163 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  27.46 
 
 		 525 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1750 aa  80.1  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.6 
 
 		 930 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  27.94 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.18 
 
 		 1146 aa  76.6  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  28.27 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  24.7 
 
 		 414 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  28.74 
 
 		 418 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  27.74 
 
 		 1026 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 368 aa  72.8  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  34.51 
 
 		 1068 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  34.81 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.37 
 
 		 363 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.11 
 
 		 355 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  27.89 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  29.38 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  29.82 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  28.8 
 
 		 1140 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  27.92 
 
 		 395 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  30.83 
 
 		 355 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.51 
 
 		 307 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  26.7 
 
 		 361 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.41 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  24.82 
 
 		 786 aa  65.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  27.52 
 
 		 1051 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 		 963 aa  63.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.71 
 
 		 1292 aa  64.3  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  28.49 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.29 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.16 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  26.97 
 
 		 412 aa  62  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  24.15 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  39.53 
 
 		 304 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.1 
 
 		 1130 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0433  NHL domain/cytochrome c family protein  30.16 
 
 		 930 aa  60.1  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102411  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  28.36 
 
 		 2296 aa  59.3  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  24.42 
 
 		 639 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1230 aa  56.6  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1861  Phage tail protein  29.1 
 
 		 747 aa  56.6  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 		 807 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2914  NHL repeat-containing protein  23.14 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  25.46 
 
 		 436 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.29 
 
 		 693 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.37 
 
 		 1030 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 892 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  30.68 
 
 		 888 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.05 
 
 		 700 aa  53.9  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  22.96 
 
 		 1351 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.12 
 
 		 646 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 1177 aa  52.8  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  24.77 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  23.11 
 
 		 772 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  26.35 
 
 		 913 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  36.71 
 
 		 322 aa  50.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4090  serine/threonine protein kinase  24.61 
 
 		 756 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.252638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  24.8 
 
 		 850 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>