51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0862 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1231    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  65.28 
 
 		 1058 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  51.9 
 
 		 581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  51.66 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  51.66 
 
 		 584 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  43.37 
 
 		 569 aa  392  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  48.53 
 
 		 601 aa  368  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2198  hypothetical protein  35.76 
 
 		 342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0000179032  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  29.5 
 
 		 909 aa  74.7  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  50.67 
 
 		 1867 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  30.8 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 1884 aa  64.3  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  44 
 
 		 3927 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5245  glucose/sorbosone dehydrogenases-like protein  39.33 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  42.11 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01543  probable RTX (repeat in structural toxin)  40.26 
 
 		 139 aa  60.8  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  35.45 
 
 		 997 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  53.85 
 
 		 2377 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  36.46 
 
 		 2305 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1046 aa  58.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  50 
 
 		 1416 aa  57.4  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.7 
 
 		 4978 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  55.81 
 
 		 1063 aa  53.9  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  41.33 
 
 		 1712 aa  53.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  26.77 
 
 		 880 aa  52.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  25.74 
 
 		 565 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  49.02 
 
 		 1141 aa  52.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  37.17 
 
 		 2310 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  33.71 
 
 		 5745 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  49.06 
 
 		 4231 aa  51.6  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  51.2  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 		 885 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  53.49 
 
 		 1597 aa  50.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  38.16 
 
 		 2542 aa  50.1  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  35.35 
 
 		 898 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  23.63 
 
 		 3378 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  30 
 
 		 1433 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4744  putative outer membrane adhesin like protein  27.49 
 
 		 666 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.511214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  32 
 
 		 1512 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 934 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.86 
 
 		 2114 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01568  putative unknown lipoprotein  37.97 
 
 		 157 aa  48.5  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  36.05 
 
 		 910 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4149  RTX toxin, putative  37.65 
 
 		 5020 aa  45.8  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  23.27 
 
 		 792 aa  45.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  60 
 
 		 3363 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  55.81 
 
 		 1949 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  39.44 
 
 		 4748 aa  43.9  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  31.87 
 
 		 927 aa  43.9  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0847  putative outer membrane adhesin like protein  46.51 
 
 		 567 aa  43.9  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189392  normal  0.116719 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>