50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2332 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2332  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1626    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0190832 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5925  WD40 domain-containing protein  28.76 
 
 
997 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0246  hypothetical protein  27.52 
 
 
650 aa  107  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.803381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5030  glycoside hydrolase family protein  31.13 
 
 
885 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.277971  normal  0.200228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2334  hypothetical protein  22.65 
 
 
634 aa  90.1  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00364711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.78 
 
 
2816 aa  82.4  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1722  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 
934 aa  77.4  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.594892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6043  hypothetical protein  45.45 
 
 
601 aa  75.1  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0622652  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5057  hypothetical protein  29.46 
 
 
3378 aa  75.5  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0864  hypothetical protein  46.46 
 
 
569 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.244567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1597  hypothetical protein  40.4 
 
 
898 aa  72.4  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.489596 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5058  hypothetical protein  36.42 
 
 
927 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.530291  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0863  hypothetical protein  34.38 
 
 
1058 aa  71.2  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0510459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0862  hypothetical protein  39.81 
 
 
613 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0172119 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5042  hypothetical protein  39.29 
 
 
906 aa  66.6  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.745587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5004  hypothetical protein  32.08 
 
 
1039 aa  64.7  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.998418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  29.6 
 
 
2305 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2748  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  29.75 
 
 
880 aa  62.8  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.873421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5754  hypothetical protein  33.33 
 
 
581 aa  61.2  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5378  hypothetical protein  35.22 
 
 
584 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5467  hypothetical protein  35.22 
 
 
584 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0247236 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2538  peptidase S15  28.32 
 
 
887 aa  57.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0780  hypothetical protein  32.61 
 
 
909 aa  57.4  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3789  peptidase M4, thermolysin  35.98 
 
 
910 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.04 
 
 
1949 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4603  outer membrane adhesin like proteiin  45.16 
 
 
1867 aa  56.2  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.873009  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  38.66 
 
 
2310 aa  55.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4077  peptidase S15  29.96 
 
 
854 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122952  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.07 
 
 
892 aa  52.4  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.72 
 
 
1750 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2562  hypothetical protein  32.54 
 
 
565 aa  52.4  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.367997 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.62 
 
 
2507 aa  51.6  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  36.27 
 
 
2542 aa  50.8  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  38.1 
 
 
2153 aa  49.7  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1297  hypothetical protein  42.68 
 
 
180 aa  49.7  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.539184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  41.94 
 
 
2377 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.46 
 
 
1884 aa  48.9  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  49.06 
 
 
4978 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  31.76 
 
 
3927 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4736  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.48 
 
 
1433 aa  47.8  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10907  hypothetical protein  38.16 
 
 
500 aa  47  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.25 
 
 
5745 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1698  hypothetical protein  28.76 
 
 
1046 aa  46.6  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.91163  normal  0.814773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5913  putative outer membrane adhesin like proteiin  45.07 
 
 
1063 aa  46.6  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278208  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.62 
 
 
4220 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  47.27 
 
 
2114 aa  45.8  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  32.14 
 
 
4798 aa  45.8  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3594  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  40.79 
 
 
1056 aa  44.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207597  normal  0.593254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  40.62 
 
 
1416 aa  44.7  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  27.63 
 
 
3191 aa  44.7  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>