29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0661 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0661  hypothetical protein  100 
 
 		 3360 aa  6717    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05162  hypothetical protein  45.72 
 
 		 3771 aa  2332    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1060  conserved repeat domain protein  26.58 
 
 		 4897 aa  555  1e-156  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3667  parallel beta-helix repeat-containing transcriptional regulator AraC  31.1 
 
 		 2078 aa  91.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  31.1 
 
 		 3634 aa  91.7  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  23.71 
 
 		 3471 aa  88.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3573  hypothetical protein  50 
 
 		 3486 aa  87  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0048  hypothetical protein  46.25 
 
 		 1946 aa  85.1  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  41 
 
 		 1441 aa  83.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  41 
 
 		 1898 aa  83.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3080  hypothetical protein  42.5 
 
 		 2853 aa  77.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  42.5 
 
 		 2886 aa  75.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2393  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1809 aa  72.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  26.42 
 
 		 2000 aa  72.4  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  30.23 
 
 		 2118 aa  63.9  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  25.39 
 
 		 1984 aa  63.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  21.34 
 
 		 1332 aa  62.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  26.8 
 
 		 2434 aa  59.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  23.22 
 
 		 4896 aa  58.9  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  22.14 
 
 		 2487 aa  57  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  27.51 
 
 		 2418 aa  53.1  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  23.37 
 
 		 2485 aa  52.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11500  conserved repeat protein  24.51 
 
 		 3920 aa  52.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  23.57 
 
 		 1989 aa  52  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  22.93 
 
 		 2490 aa  50.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  22.28 
 
 		 1118 aa  50.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  24.02 
 
 		 2358 aa  47.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.02 
 
 		 2358 aa  47.8  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  23.87 
 
 		 2490 aa  46.6  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>