54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3255 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  100 
 
 
612 aa  1219    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0312  hypothetical protein  29.14 
 
 
775 aa  133  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0887413  decreased coverage  0.00223033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06070  hypothetical protein  33.33 
 
 
676 aa  124  7e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.179469  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0749  conserved repeat domain-containing protein  31.75 
 
 
1129 aa  114  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2474  conserved repeat domain protein  27.79 
 
 
1293 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.558033  hitchhiker  0.00737149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1461  hypothetical protein  32.2 
 
 
406 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000257739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4941  hypothetical protein  42.95 
 
 
845 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0859388 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5066  hypothetical protein  32.51 
 
 
807 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.493331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3253  hypothetical protein  37.21 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00034855  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  26.18 
 
 
5010 aa  67.8  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2481  conserved repeat domain protein  28.97 
 
 
3921 aa  67  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  26.53 
 
 
5017 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  26.24 
 
 
5017 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  26.24 
 
 
5017 aa  65.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  26.53 
 
 
5017 aa  64.7  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  26.24 
 
 
5010 aa  64.7  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  26.24 
 
 
5017 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  25.66 
 
 
5010 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  23.02 
 
 
1108 aa  64.3  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  48.39 
 
 
644 aa  63.9  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 
1989 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  25.29 
 
 
5010 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  34.43 
 
 
3602 aa  60.8  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  34.05 
 
 
3471 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3666  hypothetical protein  34.13 
 
 
1537 aa  57.4  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0203  conserved repeat domain protein  22.96 
 
 
5298 aa  56.2  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3403  hypothetical protein  34.62 
 
 
3634 aa  56.2  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  22.22 
 
 
571 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  37.04 
 
 
907 aa  52.4  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0803  RNA polymerase sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.42 
 
 
831 aa  51.2  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  25.47 
 
 
2490 aa  50.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  33.84 
 
 
983 aa  50.8  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  25.05 
 
 
2358 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  20.78 
 
 
3409 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  25.05 
 
 
2358 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.05 
 
 
2490 aa  47.8  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  25.97 
 
 
2489 aa  47.4  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3689  hypothetical protein  26.98 
 
 
359 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.4 
 
 
2490 aa  47.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.05 
 
 
2490 aa  47.4  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  30.53 
 
 
1332 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3363  hypothetical protein  23.4 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.749337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3449  hypothetical protein  23.05 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3720  hypothetical protein  23.05 
 
 
359 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.24993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  19.84 
 
 
3471 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3668  hypothetical protein  23.05 
 
 
356 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.09 
 
 
4896 aa  45.4  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3693  hypothetical protein  25.58 
 
 
356 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1327  hypothetical protein  38.14 
 
 
354 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178227  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  30.77 
 
 
2573 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3413  hypothetical protein  22.7 
 
 
359 aa  44.3  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0047  hypothetical protein  33.33 
 
 
1441 aa  44.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  25.53 
 
 
2485 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4277  hypothetical protein  31.68 
 
 
1227 aa  43.9  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>