16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1327 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1327  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  684    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178227  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3253  hypothetical protein  42.76 
 
 		 376 aa  177  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00034855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1325  hypothetical protein  32.83 
 
 		 333 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183537  normal  0.158275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  35.97 
 
 		 644 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3251  hypothetical protein  29.79 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  33.72 
 
 		 900 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2520 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  34.07 
 
 		 722 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3255  hypothetical protein  37.86 
 
 		 612 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  32.94 
 
 		 1857 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  32.94 
 
 		 2121 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  31.18 
 
 		 2886 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  29.41 
 
 		 2520 aa  43.9  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  35.29 
 
 		 5010 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  32.28 
 
 		 5017 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  32.94 
 
 		 5010 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>