39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1325 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1325  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  632  1e-180  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183537  normal  0.158275 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3251  hypothetical protein  43.41 
 
 
346 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174149  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3253  hypothetical protein  33.33 
 
 
376 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00034855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1327  hypothetical protein  32.86 
 
 
354 aa  87  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.178227  normal  0.0911874 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  30.23 
 
 
722 aa  60.1  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  31.17 
 
 
897 aa  57.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2441  hypothetical protein  30 
 
 
643 aa  56.2  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  37.35 
 
 
900 aa  54.3  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2276  proprotein convertase, P  32.54 
 
 
644 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902381  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5332  cell wall anchor domain-containing protein  36.59 
 
 
975 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  41.77 
 
 
2520 aa  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5389  surface protein, lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.59 
 
 
939 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  43.04 
 
 
1857 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  43.04 
 
 
2121 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  41.77 
 
 
2520 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1856  cell wall surface anchor family protein  35.29 
 
 
1108 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  36.59 
 
 
2490 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  36.59 
 
 
2485 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
5010 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0435  conserved repeat domain protein  34.41 
 
 
2886 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  39.02 
 
 
2490 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  33.33 
 
 
5010 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  34.52 
 
 
5017 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  39.02 
 
 
2358 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  39.02 
 
 
2490 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  39.02 
 
 
2358 aa  45.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  39.02 
 
 
2490 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  31.72 
 
 
924 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  37.8 
 
 
2490 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  34.52 
 
 
5017 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  34.52 
 
 
5017 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  34.15 
 
 
5010 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  34.52 
 
 
5017 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  31.37 
 
 
5010 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  35.37 
 
 
2490 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  35.37 
 
 
2113 aa  43.9  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  35.37 
 
 
1533 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  32.99 
 
 
2487 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  33.33 
 
 
5017 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>