17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2432 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2432  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1412    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.160714  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0752  conserved repeat domain-containing protein  38.32 
 
 		 897 aa  300  7e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.389587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0751  conserved repeat domain-containing protein  27.32 
 
 		 909 aa  99.8  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.149924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0310  hypothetical protein  26.41 
 
 		 924 aa  84  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0718706 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2799  conserved repeat domain protein  26.99 
 
 		 898 aa  81.6  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.581071  normal  0.278482 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1514  hypothetical protein  25.76 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0844616  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5944  conserved repeat domain protein  28.85 
 
 		 969 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1325  hypothetical protein  35.29 
 
 		 333 aa  55.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.183537  normal  0.158275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0405  hypothetical protein  27.98 
 
 		 977 aa  55.1  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0110299 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  30.3 
 
 		 2000 aa  53.9  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  28.57 
 
 		 1984 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1513  hypothetical protein  23.61 
 
 		 972 aa  49.3  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  23.15 
 
 		 522 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3253  hypothetical protein  26.01 
 
 		 376 aa  47.8  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00034855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1521  conserved repeat domain protein  28.83 
 
 		 435 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000177441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3251  hypothetical protein  28.57 
 
 		 346 aa  45.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174149  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  30.15 
 
 		 2418 aa  44.7  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>