13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3369 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  100 
 
 
522 aa  1052    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1836  hypothetical protein  34.29 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000360269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  24.73 
 
 
379 aa  93.6  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  22.92 
 
 
388 aa  86.3  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  22.55 
 
 
388 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  22.51 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  24.94 
 
 
409 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  23.73 
 
 
380 aa  73.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  24.43 
 
 
492 aa  61.6  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  24.24 
 
 
596 aa  59.7  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  20.24 
 
 
395 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  20.89 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  20.8 
 
 
277 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>