17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2876 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  100 
 
 		 277 aa  564  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  55.6 
 
 		 288 aa  315  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  38.52 
 
 		 388 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  32.57 
 
 		 388 aa  145  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  31.4 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  31.74 
 
 		 379 aa  136  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  31.51 
 
 		 395 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  31.14 
 
 		 380 aa  126  5e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  29.39 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  25.22 
 
 		 492 aa  86.7  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  24.35 
 
 		 476 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  30.33 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  29.07 
 
 		 596 aa  52.4  0.000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.92 
 
 		 1276 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  22.27 
 
 		 522 aa  49.3  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  25.75 
 
 		 577 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2258  xylan 1,4-beta-xylosidase  31.25 
 
 		 1102 aa  43.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219101  normal  0.0256212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>