11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1408 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  32.77 
 
 		 393 aa  61.6  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  29.2 
 
 		 277 aa  62  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  30.51 
 
 		 388 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  25.93 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  28.57 
 
 		 395 aa  51.6  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  30.94 
 
 		 409 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  27.59 
 
 		 379 aa  51.2  0.000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  26.77 
 
 		 476 aa  49.3  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  26.72 
 
 		 288 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  27.27 
 
 		 380 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>