15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1340 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  964    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  42.47 
 
 		 492 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  27.95 
 
 		 388 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  28.57 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  26.32 
 
 		 409 aa  85.5  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  27.66 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  24.35 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  24.71 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  23.91 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  24.89 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  26.09 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  27.08 
 
 		 388 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  20.89 
 
 		 522 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  29.63 
 
 		 587 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  27.1 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>