20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1576 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  786    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  34.42 
 
 
395 aa  220  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  35.75 
 
 
393 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  35 
 
 
380 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  34.36 
 
 
379 aa  218  1e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  35.91 
 
 
388 aa  212  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  43.15 
 
 
288 aa  205  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  34.64 
 
 
409 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  38.52 
 
 
277 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  29.13 
 
 
492 aa  116  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  27.95 
 
 
476 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  22.55 
 
 
522 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1836  hypothetical protein  23.34 
 
 
402 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000360269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  24.62 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  22.26 
 
 
577 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0486  S-layer-like domain-containing protein  23.48 
 
 
428 aa  54.3  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  25.41 
 
 
180 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1773  peptidase M11 gametolysin  24.73 
 
 
1027 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.27 
 
 
1276 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3152  conserved repeat domain protein  27.89 
 
 
1716 aa  44.7  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>