18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0727 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  786    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  75.38 
 
 		 393 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  67.01 
 
 		 388 aa  531  1e-149  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  46.96 
 
 		 379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  43.91 
 
 		 380 aa  289  6e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  42.24 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  34.42 
 
 		 388 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  36.43 
 
 		 288 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  31.51 
 
 		 277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  23.65 
 
 		 492 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  24.89 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  24.27 
 
 		 577 aa  62  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  20.72 
 
 		 522 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.98 
 
 		 1276 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1836  hypothetical protein  23.3 
 
 		 402 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000360269  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  28.57 
 
 		 180 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  38.04 
 
 		 927 aa  43.5  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1677  hypothetical protein  24.87 
 
 		 429 aa  43.5  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.151695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>