14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0132 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  100 
 
 		 577 aa  1142    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  25.93 
 
 		 596 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  25.94 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  22.26 
 
 		 388 aa  70.1  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  26.11 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  24.27 
 
 		 395 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  26.18 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  26.45 
 
 		 380 aa  55.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  26 
 
 		 492 aa  53.5  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  25.75 
 
 		 277 aa  47.4  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  23.33 
 
 		 388 aa  47.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0090  hypothetical protein  40.43 
 
 		 677 aa  43.9  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.02 
 
 		 788 aa  43.5  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 824 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>