18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0756 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  100 
 
 
492 aa  1001    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  42.92 
 
 
476 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  29.13 
 
 
388 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  28 
 
 
409 aa  93.6  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  25.22 
 
 
277 aa  87  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  25.93 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  26.18 
 
 
596 aa  80.1  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  23.65 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  27.39 
 
 
288 aa  75.5  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  23.14 
 
 
393 aa  73.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  26.14 
 
 
380 aa  67  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  23.14 
 
 
388 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  24.43 
 
 
522 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  26 
 
 
577 aa  53.5  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3732  parallel beta-helix repeat-containing protein  24.76 
 
 
1822 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3211  alpha-fucosidase  35.82 
 
 
1193 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.084179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3244  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.68 
 
 
1829 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.443436  normal  0.888185 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000064  Ca2+-binding protein  29.41 
 
 
594 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.731988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>