More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0568 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 927 aa  1852    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  41.56 
 
 		 897 aa  488  1e-136  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.56 
 
 		 839 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.56 
 
 		 820 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  33.29 
 
 		 831 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.27 
 
 		 814 aa  403  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  36.41 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  35.12 
 
 		 915 aa  398  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  33.97 
 
 		 914 aa  396  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  32.73 
 
 		 866 aa  392  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  31.04 
 
 		 870 aa  379  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  30.59 
 
 		 857 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  34.47 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  34.47 
 
 		 922 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  32.29 
 
 		 887 aa  364  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  30.73 
 
 		 832 aa  360  6e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.21 
 
 		 1072 aa  357  3.9999999999999996e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  32.23 
 
 		 721 aa  355  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  33.73 
 
 		 845 aa  351  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  32.74 
 
 		 838 aa  347  7e-94  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  30.54 
 
 		 851 aa  347  7e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  31.99 
 
 		 839 aa  343  8e-93  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  35.23 
 
 		 832 aa  343  1e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.7 
 
 		 933 aa  338  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  33.02 
 
 		 738 aa  335  2e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  31.36 
 
 		 843 aa  335  3e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  32.76 
 
 		 738 aa  334  5e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  30.42 
 
 		 843 aa  331  3e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  31.47 
 
 		 894 aa  325  3e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.66 
 
 		 966 aa  322  1.9999999999999998e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  31.64 
 
 		 884 aa  320  7.999999999999999e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  32.41 
 
 		 906 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  30.92 
 
 		 913 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  30.8 
 
 		 897 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  32.25 
 
 		 850 aa  310  5.9999999999999995e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  51.44 
 
 		 987 aa  310  5.9999999999999995e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  31.66 
 
 		 852 aa  303  1e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.76 
 
 		 1158 aa  302  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.81 
 
 		 716 aa  301  3e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  30.1 
 
 		 886 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  31.93 
 
 		 881 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3540  Beta-glucosidase  32.41 
 
 		 816 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  31.4 
 
 		 772 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  40.89 
 
 		 1338 aa  284  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  31.51 
 
 		 898 aa  275  4.0000000000000004e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  31.62 
 
 		 904 aa  275  4.0000000000000004e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.5 
 
 		 777 aa  271  4e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  31.78 
 
 		 882 aa  268  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  32.03 
 
 		 882 aa  266  8.999999999999999e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.9 
 
 		 1321 aa  266  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  29.22 
 
 		 893 aa  255  3e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.78 
 
 		 795 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 		 875 aa  244  7.999999999999999e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  31.74 
 
 		 849 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  35.17 
 
 		 731 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.32 
 
 		 734 aa  231  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1611  glycoside hydrolase family protein  30.73 
 
 		 764 aa  231  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  28.59 
 
 		 765 aa  228  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  45.85 
 
 		 733 aa  226  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.32 
 
 		 784 aa  225  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  27.9 
 
 		 763 aa  223  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  46.76 
 
 		 733 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  46.76 
 
 		 733 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  46.76 
 
 		 733 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  44.77 
 
 		 733 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  37.65 
 
 		 730 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  39.6 
 
 		 760 aa  218  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 		 745 aa  217  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  40.2 
 
 		 693 aa  216  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  33.54 
 
 		 738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  30.6 
 
 		 934 aa  212  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.63 
 
 		 757 aa  212  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  37.16 
 
 		 762 aa  212  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  25.16 
 
 		 972 aa  210  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03903  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  29.95 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.405433  normal  0.387102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.1 
 
 		 750 aa  210  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.02 
 
 		 711 aa  209  2e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.2 
 
 		 755 aa  208  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.56 
 
 		 755 aa  208  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.49 
 
 		 749 aa  207  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.49 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  27.08 
 
 		 763 aa  205  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  44.57 
 
 		 691 aa  204  5e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  43.12 
 
 		 731 aa  204  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  47.03 
 
 		 733 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.76 
 
 		 747 aa  201  5e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  46.19 
 
 		 733 aa  201  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  44.04 
 
 		 737 aa  201  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  35.02 
 
 		 375 aa  200  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.1 
 
 		 757 aa  200  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  36.46 
 
 		 748 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  35.02 
 
 		 375 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2328  beta-glucosidase  42.75 
 
 		 302 aa  198  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.660208  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  33.56 
 
 		 829 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  33.14 
 
 		 895 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.55 
 
 		 742 aa  196  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2761  glycoside hydrolase family 3 protein  26.12 
 
 		 788 aa  195  4e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  30.64 
 
 		 811 aa  194  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  39.89 
 
 		 836 aa  194  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  35.71 
 
 		 549 aa  194  7e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>