More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0662 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  49.92 
 
 		 790 aa  685    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  51.46 
 
 		 755 aa  782    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  48.33 
 
 		 777 aa  655    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  51.52 
 
 		 762 aa  799    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  44.39 
 
 		 800 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 747 aa  1549    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50.71 
 
 		 757 aa  692    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  46.64 
 
 		 749 aa  648    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  47.35 
 
 		 750 aa  660    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  49.32 
 
 		 737 aa  674    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  44.9 
 
 		 741 aa  637    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  44.87 
 
 		 750 aa  637    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  52.75 
 
 		 755 aa  815    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  52.87 
 
 		 749 aa  782    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  44.61 
 
 		 740 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  54.88 
 
 		 758 aa  775    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.62 
 
 		 751 aa  632  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.42 
 
 		 742 aa  603  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.04 
 
 		 758 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  44.73 
 
 		 757 aa  578  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  43.34 
 
 		 760 aa  570  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.26 
 
 		 748 aa  570  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.36 
 
 		 813 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  44.07 
 
 		 874 aa  555  1e-157  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.8 
 
 		 737 aa  539  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.33 
 
 		 809 aa  537  1e-151  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.12 
 
 		 780 aa  498  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  39.03 
 
 		 738 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.37 
 
 		 734 aa  452  1.0000000000000001e-126  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.41 
 
 		 711 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  36.87 
 
 		 745 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  37.69 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  37.83 
 
 		 721 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  36.81 
 
 		 793 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 		 793 aa  431  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  37.59 
 
 		 708 aa  425  1e-117  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  36.96 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  35.75 
 
 		 721 aa  410  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  36.33 
 
 		 814 aa  411  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  37.5 
 
 		 714 aa  408  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  36.56 
 
 		 717 aa  404  1e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.75 
 
 		 757 aa  395  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  34.08 
 
 		 716 aa  382  1e-105  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.14 
 
 		 933 aa  386  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.16 
 
 		 497 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 		 756 aa  363  4e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  32.99 
 
 		 685 aa  363  9e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  37.35 
 
 		 987 aa  362  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 		 1072 aa  359  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  34.41 
 
 		 731 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.65 
 
 		 1158 aa  349  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  33 
 
 		 691 aa  346  1e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.19 
 
 		 746 aa  343  5.999999999999999e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  32.91 
 
 		 731 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  33.05 
 
 		 731 aa  340  4e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  35.01 
 
 		 693 aa  340  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  33.05 
 
 		 922 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  32.77 
 
 		 737 aa  338  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  33.48 
 
 		 733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  33.38 
 
 		 748 aa  338  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  32.58 
 
 		 730 aa  336  7.999999999999999e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  32.81 
 
 		 733 aa  331  2e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.74 
 
 		 724 aa  331  3e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  32.53 
 
 		 733 aa  330  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  35.05 
 
 		 748 aa  328  2.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 733 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  32.43 
 
 		 733 aa  326  9e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.95 
 
 		 762 aa  319  9e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  33.48 
 
 		 735 aa  316  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.67 
 
 		 1321 aa  313  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.12 
 
 		 778 aa  311  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  31.84 
 
 		 829 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  33.66 
 
 		 751 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.98 
 
 		 778 aa  311  4e-83  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  30.76 
 
 		 822 aa  310  5e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  33.66 
 
 		 748 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  34.46 
 
 		 779 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  33.94 
 
 		 751 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  33.94 
 
 		 751 aa  310  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  31.19 
 
 		 1338 aa  308  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.24 
 
 		 805 aa  307  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  32.62 
 
 		 772 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  32.14 
 
 		 743 aa  301  2e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  31.67 
 
 		 731 aa  300  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  45.26 
 
 		 914 aa  299  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  44.81 
 
 		 823 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.54 
 
 		 814 aa  297  6e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  43.56 
 
 		 820 aa  296  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.88 
 
 		 771 aa  295  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 931 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.34 
 
 		 772 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  30.39 
 
 		 777 aa  291  2e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  44.26 
 
 		 915 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  31.38 
 
 		 819 aa  287  5e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 727 aa  287  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.84 
 
 		 754 aa  286  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.63 
 
 		 751 aa  283  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  32.69 
 
 		 765 aa  280  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>