More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2324 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2418  Beta-glucosidase  94.81 
 
 		 751 aa  1330    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.022971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2324  Beta-glucosidase  100 
 
 		 748 aa  1505    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.887692 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1802  Beta-glucosidase  95.34 
 
 		 751 aa  1336    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2459  Beta-glucosidase  97.99 
 
 		 779 aa  1335    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2414  Beta-glucosidase  95.34 
 
 		 751 aa  1336    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4061  Beta-glucosidase  45.64 
 
 		 731 aa  621  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.905446  normal  0.0160169 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  47.08 
 
 		 733 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  47.08 
 
 		 733 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  47.08 
 
 		 733 aa  599  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  47.43 
 
 		 922 aa  598  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  47.3 
 
 		 731 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  47.47 
 
 		 731 aa  593  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  46.82 
 
 		 733 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  48.35 
 
 		 733 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  46.69 
 
 		 733 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  47.38 
 
 		 733 aa  571  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3622  Beta-glucosidase  46.24 
 
 		 748 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.642494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2140  Beta-glucosidase  45.03 
 
 		 748 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0303148  normal  0.0291608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1729  Beta-glucosidase  45.44 
 
 		 737 aa  532  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.830877  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00676  beta-glucosidase  44.21 
 
 		 735 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.790026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2371  Beta-glucosidase  42.19 
 
 		 931 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0188684  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3288  Beta-glucosidase  43.4 
 
 		 730 aa  497  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.362005  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3266  Beta-glucosidase  38.43 
 
 		 731 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.700577  normal  0.395195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10187  beta-glucosidase bglS  42.51 
 
 		 691 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0432606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3845  Beta-glucosidase  40.28 
 
 		 987 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822537  normal  0.0429767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.91 
 
 		 933 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.97 
 
 		 1072 aa  421  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.93 
 
 		 758 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.93 
 
 		 749 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.41 
 
 		 745 aa  401  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.88 
 
 		 755 aa  396  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  36.77 
 
 		 755 aa  391  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  33.98 
 
 		 762 aa  389  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  52.31 
 
 		 549 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  39.52 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.04 
 
 		 757 aa  381  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3493  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 1158 aa  381  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035247  normal  0.808735 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.29 
 
 		 734 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6143  hypothetical protein  37.45 
 
 		 693 aa  369  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601803  normal  0.287239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0214  glycoside hydrolase family 3 protein  32.79 
 
 		 800 aa  363  6e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1569  Beta-glucosidase-related glycosidase  34.95 
 
 		 737 aa  362  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0251  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.59 
 
 		 790 aa  362  2e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3389  glycoside hydrolase family 3 protein  32.3 
 
 		 738 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.461339  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3267  Beta-glucosidase  33.37 
 
 		 829 aa  361  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.27 
 
 		 750 aa  361  3e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.41 
 
 		 757 aa  359  9.999999999999999e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  35.94 
 
 		 749 aa  358  1.9999999999999998e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1839  glycoside hydrolase family 3 protein  37.78 
 
 		 750 aa  356  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0662  glycoside hydrolase family 3 protein  34.58 
 
 		 747 aa  355  2e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.409181  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2454  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 		 711 aa  353  8e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000849999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  37.41 
 
 		 777 aa  350  4e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1481  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.45 
 
 		 737 aa  348  2e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0920  glycoside hydrolase family 3 protein  33.74 
 
 		 721 aa  348  2e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.85 
 
 		 758 aa  347  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2157  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.21 
 
 		 746 aa  347  4e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  53.82 
 
 		 380 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  53.82 
 
 		 380 aa  343  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0270  glycoside hydrolase family 3 protein  33.56 
 
 		 685 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4872  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.18 
 
 		 742 aa  341  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703586  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0220  glycoside hydrolase family 3 protein  31.08 
 
 		 721 aa  341  2.9999999999999998e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2994  glycosy hydrolase family protein  33.15 
 
 		 793 aa  340  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3072  glycoside hydrolase family 3 protein  33.02 
 
 		 793 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0898  glycoside hydrolase family 3 protein  33.29 
 
 		 722 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0456  glycoside hydrolase family 3 protein  37.04 
 
 		 760 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0287  glycoside hydrolase family 3 protein  31.54 
 
 		 717 aa  335  2e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1945  beta-glucosidase-like glycosidase  34.24 
 
 		 757 aa  334  3e-90  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0140662  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0875  Beta-glucosidase-related glycosidase  32.82 
 
 		 741 aa  332  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.155789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2530  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 748 aa  332  1e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49793  beta-glucosidase  33.87 
 
 		 874 aa  326  1e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5042  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.84 
 
 		 1321 aa  326  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1494  glycoside hydrolase family 3 protein  34.22 
 
 		 701 aa  325  2e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.643815  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3392  glycoside hydrolase family 3 protein  31.82 
 
 		 814 aa  325  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.538659  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1599  glycoside hydrolase family 3 protein  31.39 
 
 		 714 aa  323  8e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.367707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1311  glycoside hydrolase family 3 protein  34.1 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.313843  normal  0.190988 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6030  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 		 780 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1609  Beta-glucosidase  33.61 
 
 		 1338 aa  313  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0886  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 751 aa  312  1e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02290  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.39 
 
 		 809 aa  304  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2534  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.1 
 
 		 813 aa  301  4e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05170  Beta-glucosidase precursor, putative  31.06 
 
 		 716 aa  298  3e-79  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.599947  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07396  beta-glucosidase (Eurofung)  30.58 
 
 		 772 aa  290  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151913 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02828  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  35.56 
 
 		 737 aa  286  7e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.475054 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.33 
 
 		 762 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02510  beta-glucosidase, putative  30.77 
 
 		 819 aa  283  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2190  Beta-glucosidase  32.84 
 
 		 727 aa  273  6e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499174 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05976  beta-glucosidase (Eurofung)  31.66 
 
 		 822 aa  273  7e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.429409 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.48 
 
 		 756 aa  270  7e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1139  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.03 
 
 		 724 aa  263  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.96 
 
 		 790 aa  261  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  32.51 
 
 		 905 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10482  beta-1,4-glucosidase (Eurofung)  34.1 
 
 		 868 aa  258  2e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.23 
 
 		 783 aa  259  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.94 
 
 		 755 aa  258  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  27.42 
 
 		 777 aa  258  4e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  29.11 
 
 		 805 aa  257  7e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.57 
 
 		 771 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1703  putative beta-glucosidase  41.52 
 
 		 375 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.821899  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.93 
 
 		 736 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1910  putative beta-glucosidase  41.52 
 
 		 375 aa  253  9.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.31 
 
 		 782 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>