More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3329 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  100 
 
 		 972 aa  2013    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.21 
 
 		 927 aa  711    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  39.27 
 
 		 988 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  35.82 
 
 		 934 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.27 
 
 		 923 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  34.56 
 
 		 928 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  33.44 
 
 		 999 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  35.91 
 
 		 811 aa  456  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  34.42 
 
 		 875 aa  454  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.25 
 
 		 824 aa  436  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.4 
 
 		 974 aa  406  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  30.4 
 
 		 874 aa  374  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  32.11 
 
 		 949 aa  367  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  31.42 
 
 		 875 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  30.51 
 
 		 881 aa  357  7.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  29.62 
 
 		 952 aa  351  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.29 
 
 		 972 aa  343  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 898 aa  320  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  30.01 
 
 		 882 aa  320  7.999999999999999e-86  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  29.51 
 
 		 882 aa  320  1e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.08 
 
 		 851 aa  317  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.87 
 
 		 814 aa  303  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  30.84 
 
 		 915 aa  303  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  37.65 
 
 		 747 aa  286  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.63 
 
 		 886 aa  280  8e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  27.71 
 
 		 823 aa  262  2e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.06 
 
 		 820 aa  249  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  26.34 
 
 		 857 aa  248  3e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  34.55 
 
 		 733 aa  243  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  26.76 
 
 		 866 aa  242  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  27.53 
 
 		 833 aa  239  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  35.48 
 
 		 902 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  37.26 
 
 		 893 aa  235  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  27.01 
 
 		 838 aa  234  7.000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  26.35 
 
 		 831 aa  234  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  36.04 
 
 		 905 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  29.55 
 
 		 818 aa  231  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  27.36 
 
 		 845 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.03 
 
 		 889 aa  227  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.94 
 
 		 712 aa  224  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  32.77 
 
 		 904 aa  214  5.999999999999999e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  33.91 
 
 		 717 aa  214  7.999999999999999e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 864 aa  214  7.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.1 
 
 		 1357 aa  210  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  25.94 
 
 		 832 aa  209  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.02 
 
 		 1548 aa  209  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.3 
 
 		 1212 aa  203  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  38.12 
 
 		 849 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.77 
 
 		 777 aa  195  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1659  Beta-glucosidase  26.25 
 
 		 897 aa  189  3e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.287347  normal  0.593766 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  31.98 
 
 		 778 aa  187  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.96 
 
 		 756 aa  187  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.97 
 
 		 778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  31.52 
 
 		 763 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.36 
 
 		 795 aa  184  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.38 
 
 		 772 aa  183  1e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.54 
 
 		 782 aa  183  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.42 
 
 		 762 aa  183  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 		 966 aa  181  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.32 
 
 		 902 aa  178  5e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  31.08 
 
 		 803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.67 
 
 		 1343 aa  176  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  32.7 
 
 		 805 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.49 
 
 		 783 aa  175  5e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  32.17 
 
 		 1037 aa  174  6.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.24 
 
 		 807 aa  173  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.23 
 
 		 755 aa  171  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  33.25 
 
 		 914 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.3 
 
 		 760 aa  169  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.65 
 
 		 754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.77 
 
 		 758 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.08 
 
 		 771 aa  165  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.01 
 
 		 792 aa  165  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  31.4 
 
 		 859 aa  165  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.51 
 
 		 760 aa  164  6e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.8 
 
 		 784 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  34.22 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  24.68 
 
 		 772 aa  161  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  30 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0692  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.1 
 
 		 736 aa  159  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0501235 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  34.5 
 
 		 759 aa  157  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  29.46 
 
 		 763 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.33 
 
 		 766 aa  156  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  23.31 
 
 		 884 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.66 
 
 		 799 aa  156  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  29.19 
 
 		 763 aa  156  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  37.78 
 
 		 843 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  29.19 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  30.42 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  29.19 
 
 		 763 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  30.43 
 
 		 740 aa  155  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 763 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  36.07 
 
 		 759 aa  154  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.29 
 
 		 760 aa  153  1e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.91 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3784  b-glucosidase, glycoside hydrolase family 3 protein  32.51 
 
 		 745 aa  153  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.299854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.08 
 
 		 738 aa  153  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35340  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  35.04 
 
 		 777 aa  152  4e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.142302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>