More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2419 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  100 
 
 		 849 aa  1714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  55.97 
 
 		 889 aa  901    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  47.62 
 
 		 902 aa  731    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  54.4 
 
 		 882 aa  887    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  54.21 
 
 		 882 aa  879    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  43.75 
 
 		 904 aa  633  1e-180  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  41.87 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  39.95 
 
 		 881 aa  577  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  38.37 
 
 		 875 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  42.65 
 
 		 898 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  33.93 
 
 		 864 aa  460  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  31.66 
 
 		 886 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  50 
 
 		 712 aa  365  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.92 
 
 		 966 aa  357  5.999999999999999e-97  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  47.52 
 
 		 733 aa  350  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  45.5 
 
 		 717 aa  345  2e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  46.63 
 
 		 905 aa  339  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.67 
 
 		 927 aa  333  7.000000000000001e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  34.9 
 
 		 934 aa  312  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  34 
 
 		 923 aa  311  4e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  32.96 
 
 		 928 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.68 
 
 		 972 aa  304  4.0000000000000003e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  32.13 
 
 		 914 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4152  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 831 aa  286  8e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.198899  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.72 
 
 		 820 aa  279  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  29.21 
 
 		 823 aa  277  7e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 999 aa  273  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  34.06 
 
 		 875 aa  272  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  32.37 
 
 		 915 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.11 
 
 		 814 aa  263  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2185  Beta-glucosidase  27.88 
 
 		 884 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122477  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  29.29 
 
 		 870 aa  257  5e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  29.3 
 
 		 857 aa  251  5e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1781  Beta-glucosidase  28.2 
 
 		 906 aa  245  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.104106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  29.46 
 
 		 832 aa  244  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0568  glycoside hydrolase family 3 protein  31.74 
 
 		 927 aa  242  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3035  glycoside hydrolase family protein  27.3 
 
 		 913 aa  238  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  0.109477 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  36.1 
 
 		 763 aa  238  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  28.7 
 
 		 866 aa  233  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00712  Beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BFG8]  30 
 
 		 845 aa  232  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.480043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0260  Beta-glucosidase  31.14 
 
 		 832 aa  229  2e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.03 
 
 		 756 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3153  Beta-glucosidase  27.45 
 
 		 913 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139372  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3694  glycosyl hydrolase, family 3  27.57 
 
 		 772 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02227  Putative beta-glucosidase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU7]  28.66 
 
 		 833 aa  226  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0629653 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3170  glycosyl hydrolase, family 3  26.63 
 
 		 897 aa  224  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.541746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3318  beta-glucosidase  26.84 
 
 		 913 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00176622  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  37.5 
 
 		 803 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  35.89 
 
 		 777 aa  220  1e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  42.03 
 
 		 874 aa  217  5.9999999999999996e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65767  beta-glucosidase  27.38 
 
 		 839 aa  216  9.999999999999999e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.893568 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  27.86 
 
 		 887 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.46 
 
 		 762 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  36.83 
 
 		 778 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  40.45 
 
 		 952 aa  214  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_1541  beta-glucosidase  28.05 
 
 		 738 aa  214  5.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.36185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61725  beta-glucosidase  27.94 
 
 		 738 aa  214  7.999999999999999e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.614554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  36.45 
 
 		 778 aa  213  1e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6130  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.6 
 
 		 813 aa  210  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0369131  decreased coverage  0.00080917 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  36.09 
 
 		 772 aa  210  9e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  29.06 
 
 		 850 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.98 
 
 		 988 aa  208  4e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  28.26 
 
 		 836 aa  207  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00370  beta-glucosidase, putative  28.14 
 
 		 852 aa  205  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.84 
 
 		 839 aa  204  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  38.71 
 
 		 790 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41452  beta-glucosidase  26.25 
 
 		 851 aa  203  9.999999999999999e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  26.08 
 
 		 843 aa  202  1.9999999999999998e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02612  Putative beta-glucosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BA18]  28.49 
 
 		 838 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.314197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  41.23 
 
 		 949 aa  199  2.0000000000000003e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  38.34 
 
 		 974 aa  197  6e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34123  beta-glucosidase  26.35 
 
 		 843 aa  196  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0475476 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.01 
 
 		 765 aa  194  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.2 
 
 		 795 aa  194  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 805 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.39 
 
 		 807 aa  193  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  35.81 
 
 		 808 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.09 
 
 		 749 aa  190  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35668  beta-xylosidase  35.03 
 
 		 682 aa  188  4e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.12421  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.97 
 
 		 771 aa  187  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1089  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  30.05 
 
 		 818 aa  186  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.946532  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3027  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.25 
 
 		 765 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  36.68 
 
 		 859 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  35.64 
 
 		 763 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  33.56 
 
 		 774 aa  184  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  32.23 
 
 		 787 aa  182  2e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.31 
 
 		 782 aa  182  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.7 
 
 		 792 aa  182  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.54 
 
 		 902 aa  182  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  36.36 
 
 		 802 aa  181  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.86 
 
 		 751 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 		 809 aa  181  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.48 
 
 		 760 aa  180  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3237  glycoside hydrolase family 3 protein  35.39 
 
 		 768 aa  180  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  32.1 
 
 		 763 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  32.1 
 
 		 763 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0867  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.01 
 
 		 783 aa  178  4e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0187  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.24 
 
 		 803 aa  178  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.168839  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  32.1 
 
 		 763 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0155  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.6 
 
 		 755 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.167458  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>