More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1607 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  64.19 
 
 		 934 aa  1146    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  48.09 
 
 		 988 aa  815    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  100 
 
 		 928 aa  1873    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  57.65 
 
 		 999 aa  1027    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  50.64 
 
 		 875 aa  725    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  64.51 
 
 		 923 aa  1134    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  44.16 
 
 		 952 aa  624  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  45.59 
 
 		 811 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  45.13 
 
 		 974 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.9 
 
 		 927 aa  590  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  45.65 
 
 		 874 aa  592  1e-167  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.25 
 
 		 824 aa  584  1.0000000000000001e-165  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  41.5 
 
 		 949 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.66 
 
 		 972 aa  525  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  34.67 
 
 		 972 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.45 
 
 		 851 aa  489  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  33.05 
 
 		 881 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  30.62 
 
 		 875 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  29.18 
 
 		 864 aa  312  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  33.54 
 
 		 849 aa  302  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  32.25 
 
 		 914 aa  288  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  31.45 
 
 		 915 aa  274  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  28.94 
 
 		 823 aa  259  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  28.95 
 
 		 886 aa  257  7e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  29.42 
 
 		 866 aa  249  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  38.15 
 
 		 747 aa  248  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.68 
 
 		 820 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  39.47 
 
 		 893 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  38.66 
 
 		 902 aa  230  9e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3692  glycosy hydrolase family protein  28.84 
 
 		 832 aa  225  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0928  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.88 
 
 		 780 aa  225  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.92 
 
 		 712 aa  220  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.2 
 
 		 795 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  27.05 
 
 		 787 aa  218  5e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  25.88 
 
 		 857 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  36.91 
 
 		 905 aa  215  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  38.44 
 
 		 889 aa  213  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.83 
 
 		 904 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  38.54 
 
 		 898 aa  207  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  36.38 
 
 		 882 aa  201  7e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  35.9 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  38.58 
 
 		 882 aa  198  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  34.29 
 
 		 778 aa  190  9e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  31.72 
 
 		 717 aa  187  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03740  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  28.9 
 
 		 765 aa  186  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  33.81 
 
 		 778 aa  184  6e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.71 
 
 		 814 aa  184  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.63 
 
 		 1212 aa  178  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.76 
 
 		 902 aa  177  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.23 
 
 		 762 aa  175  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  34.96 
 
 		 772 aa  174  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.65 
 
 		 966 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.87 
 
 		 760 aa  171  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  31.06 
 
 		 777 aa  171  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.47 
 
 		 756 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  31.96 
 
 		 765 aa  168  2.9999999999999998e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  37.19 
 
 		 1037 aa  167  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4104  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.38 
 
 		 738 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.28211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.18 
 
 		 782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  35.27 
 
 		 805 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.97 
 
 		 755 aa  164  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0198  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.82 
 
 		 749 aa  164  6e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0901  glycoside hydrolase family 3 protein  33.27 
 
 		 790 aa  164  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72185  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02359  Beta-xylosidase (EC 3.2.1.37) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O42810]  30.43 
 
 		 803 aa  164  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  32.67 
 
 		 763 aa  161  5e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 		 792 aa  161  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  30.49 
 
 		 1548 aa  160  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1012  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.69 
 
 		 804 aa  160  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.722043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.66 
 
 		 745 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.77 
 
 		 1357 aa  159  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.57 
 
 		 1343 aa  158  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.21 
 
 		 766 aa  158  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  39.57 
 
 		 785 aa  157  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.92 
 
 		 799 aa  157  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3722  hypothetical protein  33.46 
 
 		 895 aa  157  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.265869  normal  0.601443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  33.74 
 
 		 739 aa  157  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0942  glycoside hydrolase family 3 protein  36.19 
 
 		 802 aa  157  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  33.33 
 
 		 870 aa  156  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5411  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.08 
 
 		 751 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04180  beta-N-acetylhexosaminidase  30.11 
 
 		 618 aa  156  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  33.76 
 
 		 843 aa  156  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.58 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.77 
 
 		 784 aa  155  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1022  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.64 
 
 		 758 aa  154  5.9999999999999996e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534913  normal  0.0223661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0536  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.91 
 
 		 754 aa  154  7e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0012986  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.43 
 
 		 760 aa  153  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1014  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 772 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.285084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2354  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.54 
 
 		 771 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3155  glycoside hydrolase family 3 protein  34.66 
 
 		 740 aa  152  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3521  glycoside hydrolase family 3 protein  34.3 
 
 		 766 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.656969  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  35.46 
 
 		 759 aa  153  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  32.4 
 
 		 772 aa  152  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.24 
 
 		 807 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.46 
 
 		 801 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  34.62 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>