More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_13580 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  100 
 
 
851 aa  1670    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.62 
 
 
974 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  42.04 
 
 
949 aa  519  1.0000000000000001e-145  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.67 
 
 
972 aa  484  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  41.59 
 
 
923 aa  477  1e-133  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  39.45 
 
 
928 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  41.21 
 
 
999 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  40.24 
 
 
934 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  41.23 
 
 
874 aa  469  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  40.5 
 
 
952 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  41.08 
 
 
875 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  38.86 
 
 
811 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.44 
 
 
988 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.13 
 
 
927 aa  346  1e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  30.08 
 
 
972 aa  317  4e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  46.8 
 
 
824 aa  306  9.000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  27.28 
 
 
881 aa  192  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  28.98 
 
 
889 aa  188  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  28.01 
 
 
904 aa  175  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  35.73 
 
 
898 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  34.79 
 
 
747 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  33.16 
 
 
893 aa  165  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  32.4 
 
 
902 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  34.01 
 
 
882 aa  161  4e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  33.75 
 
 
882 aa  159  2e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  31.17 
 
 
717 aa  156  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.13 
 
 
712 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  27.49 
 
 
864 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  30.54 
 
 
733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08401  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  31.08 
 
 
763 aa  141  4.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  33.16 
 
 
849 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  30.48 
 
 
905 aa  135  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2630  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 
782 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  28.79 
 
 
875 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.96 
 
 
762 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  27.37 
 
 
1212 aa  127  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2247  putative beta-D-glucosidase  30.84 
 
 
731 aa  124  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19810  beta-glucosidase  29.59 
 
 
739 aa  124  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2327  beta-glucosidase  30.84 
 
 
549 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268142  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33140  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  33 
 
 
791 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0720  beta-glucosidase  30.6 
 
 
922 aa  121  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0469034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 
778 aa  121  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  33.96 
 
 
1037 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  31.37 
 
 
763 aa  119  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  30.4 
 
 
778 aa  119  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  29.68 
 
 
777 aa  118  5e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3436  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.48 
 
 
750 aa  118  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0398792  decreased coverage  0.00586208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4410  Beta-glucosidase  30.15 
 
 
733 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.401831  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  30.83 
 
 
763 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1822  Beta-glucosidase  30 
 
 
733 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2539  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.66 
 
 
760 aa  117  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  30.83 
 
 
763 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  31.04 
 
 
772 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.01 
 
 
792 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0723  beta-glucosidase  29.95 
 
 
731 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.450244  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1129  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.14 
 
 
760 aa  115  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.993243  hitchhiker  0.000798883 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  30.83 
 
 
763 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  30.84 
 
 
763 aa  115  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0289  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.19 
 
 
758 aa  114  8.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.47 
 
 
751 aa  114  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0219  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.34 
 
 
749 aa  114  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
805 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.52 
 
 
784 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  31.84 
 
 
966 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3585  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.82 
 
 
811 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.162154  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0435  glycoside hydrolase family 3 protein  35.09 
 
 
789 aa  113  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11570  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  32.75 
 
 
785 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0110088 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  31.81 
 
 
808 aa  113  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.8 
 
 
766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2836  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.44 
 
 
757 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.73 
 
 
760 aa  112  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5261  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.54 
 
 
806 aa  111  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3617  Beta-glucosidase  30.4 
 
 
733 aa  111  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 
755 aa  111  7.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4171  Beta-glucosidase  30.33 
 
 
733 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.27054  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4195  Beta-glucosidase  30.33 
 
 
733 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3321  Beta-glucosidase  30.33 
 
 
733 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287643  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4092  Beta-glucosidase  30.4 
 
 
733 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4099  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.46 
 
 
1072 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.148886  normal  0.0624461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.97 
 
 
760 aa  109  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2268  b-glucosidase  30.25 
 
 
758 aa  109  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2421  beta-glucosidase, periplasmic  27.81 
 
 
765 aa  108  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3993  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 
753 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.848681  normal  0.0961182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1371  glycoside hydrolase family 3 protein  27.68 
 
 
765 aa  108  5e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1704  beta-glucosidase  30.58 
 
 
380 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1911  beta-glucosidase  30.58 
 
 
380 aa  108  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  29.36 
 
 
749 aa  108  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3049  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.21 
 
 
809 aa  108  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.340429  normal  0.82066 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.9 
 
 
902 aa  107  7e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1982  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.28 
 
 
807 aa  107  8e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.405653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0912  beta-glucosidase, periplasmic  27.81 
 
 
765 aa  107  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.611673 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2731  beta-galactosidase  26.76 
 
 
772 aa  107  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1934  beta-glucosidase-like glycosidase  29.57 
 
 
787 aa  107  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02062  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  27.55 
 
 
765 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  29.72 
 
 
933 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1515  glycoside hydrolase family 3 protein  27.55 
 
 
765 aa  107  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02020  hypothetical protein  27.55 
 
 
765 aa  107  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0817  glycoside hydrolase family 3 protein  28.46 
 
 
738 aa  107  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.306432 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2267  beta-glucosidase, periplasmic  27.55 
 
 
765 aa  106  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0841  beta-glucosidase, periplasmic  27.55 
 
 
765 aa  106  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>