More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2412 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0321  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.3 
 
 
927 aa  647    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5566  Beta-glucosidase  44.83 
 
 
999 aa  731    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.441417 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1607  exo-1,4-beta-glucosidase  48.09 
 
 
928 aa  807    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.124023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2168  Beta-glucosidase  48.35 
 
 
875 aa  711    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.917508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1295  glucan 1,4-beta-glucosidase  51.22 
 
 
923 aa  862    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2406  beta-glucosidase  52.53 
 
 
934 aa  902    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2412  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
988 aa  1993    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10070  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  42.73 
 
 
974 aa  619  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4940  Beta-glucosidase  44.94 
 
 
811 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0446999  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3329  glycoside hydrolase family 3 protein  39.27 
 
 
972 aa  604  1.0000000000000001e-171  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1318  Beta-glucosidase  40.58 
 
 
952 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4677  glycoside hydrolase family 3 domain protein  44.36 
 
 
824 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104486  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1770  Beta-glucosidase  41.57 
 
 
949 aa  584  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.611938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1195  Beta-glucosidase  42.79 
 
 
874 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0408  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.88 
 
 
972 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.840508  normal  0.121767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13580  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  36.44 
 
 
851 aa  435  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172657  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3883  glycoside hydrolase family 3 protein  32.01 
 
 
875 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.128454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2404  Beta-glucosidase  33.06 
 
 
898 aa  341  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3058  Beta-glucosidase  31.22 
 
 
857 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.44664  normal  0.0198614 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2042  glycoside hydrolase family 3 protein  29.22 
 
 
886 aa  290  1e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198368  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2674  ribosome-binding factor A  30.54 
 
 
866 aa  288  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3351  glycoside hydrolase family 3 protein  41.19 
 
 
747 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0596976  normal  0.962652 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6257  hypothetical protein  30.16 
 
 
823 aa  280  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.234906  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4787  glycoside hydrolase family 3 domain protein  30.5 
 
 
820 aa  271  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294133  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1487  Beta-glucosidase  40.32 
 
 
893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00296047  normal  0.272235 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1307  Beta-glucosidase  28.39 
 
 
887 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2378  Beta-glucosidase  38.06 
 
 
902 aa  256  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0896649  normal  0.197642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3219  Beta-glucosidase  38.68 
 
 
905 aa  248  4.9999999999999997e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.181827  normal  0.334225 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07865  beta-glucosidase (Eurofung)  29.13 
 
 
850 aa  244  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.533103  normal  0.802716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3246  Beta-glucosidase  37.32 
 
 
881 aa  243  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.190497  normal  0.145992 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01638  glucan 1,4-beta-glucosidase  36.8 
 
 
889 aa  240  8e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0825  Beta-glucosidase  37.07 
 
 
733 aa  231  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000149252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03856  glucan 1,4-beta-glucosidase  35.71 
 
 
904 aa  223  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0203  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.63 
 
 
712 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3874  Beta-glucosidase  33.33 
 
 
864 aa  215  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20174  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2419  Beta-glucosidase  40.62 
 
 
849 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.326586  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4883  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.26 
 
 
1212 aa  211  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0885799  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2005  Beta-glucosidase  37.8 
 
 
882 aa  210  9e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.346494  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1929  Beta-glucosidase  37.56 
 
 
882 aa  209  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0919  glycoside hydrolase family 3 protein  42.31 
 
 
914 aa  206  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3480  glycoside hydrolase family 3 protein  42.31 
 
 
915 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.409586 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4325  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.52 
 
 
1343 aa  200  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107286 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3009  glycoside hydrolase family 3 protein  32.52 
 
 
717 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.414212  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.42 
 
 
1357 aa  193  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2110  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 
894 aa  193  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4651  Beta-glucosidase  32.1 
 
 
1548 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00279613  normal  0.760952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4963  glycoside hydrolase family 3 protein  39.33 
 
 
765 aa  192  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.337001  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1217  glycoside hydrolase family 3 protein  33.12 
 
 
966 aa  192  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.0000342609  normal  0.287325 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0229  glycoside hydrolase family 3 protein  32.61 
 
 
777 aa  186  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.270264  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1723  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.93 
 
 
756 aa  186  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000651092  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0181  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.33 
 
 
755 aa  185  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2531  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.95 
 
 
902 aa  183  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0332  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
757 aa  180  9e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.69655  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0852  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.63 
 
 
762 aa  180  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0847818  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0871  glycoside hydrolase family 3 protein  32.3 
 
 
778 aa  179  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1567  glycoside hydrolase family 3 protein  36.43 
 
 
743 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.599534  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3861  glycoside hydrolase family 3 protein  38.74 
 
 
759 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.825752  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1691  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.36 
 
 
814 aa  178  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4408  glycoside hydrolase family 3 protein  38.24 
 
 
763 aa  178  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.721312  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1816  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.74 
 
 
751 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3638  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.29 
 
 
766 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456784  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2280  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.93 
 
 
799 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.94 
 
 
795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4320  glycoside hydrolase family 3 protein  37.87 
 
 
763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1403  periplasmic beta-glucosidase  37.5 
 
 
763 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1080  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.2 
 
 
792 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.353054  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1256  glycoside hydrolase family protein  38.63 
 
 
755 aa  176  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.179739  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3730  glycoside hydrolase family protein  31.84 
 
 
805 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.414697  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2785  glycoside hydrolase family 3 protein  35.05 
 
 
762 aa  174  7.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2729  Beta-glucosidase  38.49 
 
 
759 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.751661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0848  glycoside hydrolase family 3 protein  31.83 
 
 
778 aa  173  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1044  glycoside hydrolase family 3 protein  37.87 
 
 
763 aa  172  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4330  glycoside hydrolase family 3 protein  38.89 
 
 
836 aa  171  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2379  glycosy hydrolase family protein  36.06 
 
 
870 aa  171  6e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1375  glycoside hydrolase family 3 protein  40.07 
 
 
859 aa  171  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0866514  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02217  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  34.91 
 
 
759 aa  171  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.376318 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0775  glycoside hydrolase family 3 protein  35.71 
 
 
745 aa  171  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0323  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.91 
 
 
807 aa  171  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000125133  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0447  glycoside hydrolase family 3 domain protein  38.89 
 
 
734 aa  170  1e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3995  beta-D-glucoside glucohydrolase, periplasmic  37.41 
 
 
774 aa  170  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000632005  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1607  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.06 
 
 
760 aa  170  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2915  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.63 
 
 
768 aa  170  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1832  glycoside hydrolase family 3 protein  39.02 
 
 
808 aa  168  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0261035 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2497  glycoside hydrolase family 3 domain protein  35.59 
 
 
769 aa  167  5.9999999999999996e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0502  glycoside hydrolase family 3 protein  36.45 
 
 
772 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2355  periplasmic beta-glucosidase  38.6 
 
 
755 aa  167  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2311  periplasmic beta-glucosidase  38.6 
 
 
765 aa  167  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1431  glycoside hydrolase family 3 protein  38.91 
 
 
749 aa  167  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0291974  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1081  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.67 
 
 
784 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000550104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42230  periplasmic beta-glucosidase  36.4 
 
 
764 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33573  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3292  glycoside hydrolase family 3 protein  38.99 
 
 
1037 aa  167  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2069  glycoside hydrolase family 3 domain protein  42.35 
 
 
839 aa  167  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0456  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.56 
 
 
497 aa  166  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.402353  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6878  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.27 
 
 
933 aa  166  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0414286  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2400  periplasmic beta-glucosidase  38.24 
 
 
755 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2404  periplasmic beta-glucosidase  38.24 
 
 
755 aa  165  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1297  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 
763 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00926582  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51227  beta-glucosidase  37.26 
 
 
843 aa  164  5.0000000000000005e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0794  glycoside hydrolase family 3 domain protein  39.07 
 
 
801 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3580  periplasmic beta-glucosidase  36.3 
 
 
764 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0326173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>