18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1623 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1623  Alpha-galactosidase, NPCBM associated NEW3 domain protein  100 
 
 
380 aa  749    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0478497  normal  0.962511 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0459  hypothetical protein  76.24 
 
 
379 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1430  hypothetical protein  46.88 
 
 
388 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.81814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3122  hypothetical protein  42.57 
 
 
409 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.76184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0727  hypothetical protein  43.91 
 
 
395 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3210  hypothetical protein  44.72 
 
 
393 aa  294  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1576  hypothetical protein  35 
 
 
388 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2550  hypothetical protein  35.59 
 
 
288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2876  membrane protein  31.14 
 
 
277 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3369  hypothetical protein  23.47 
 
 
522 aa  90.9  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.632947  hitchhiker  0.00440971 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0756  hypothetical protein  26.14 
 
 
492 aa  75.1  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1334  membrane protein-like  27.86 
 
 
596 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.513509  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1340  hypothetical protein  26.09 
 
 
476 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1836  hypothetical protein  22.8 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000360269  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0132  membrane protein-like  25.3 
 
 
577 aa  58.2  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  28.28 
 
 
1861 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1408  hypothetical protein  26.55 
 
 
180 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.753488  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.13 
 
 
1276 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>