12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0750 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0750  hypothetical protein  100 
 
 
1861 aa  3665    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2800  protein of unknown function DUF11  50.54 
 
 
1861 aa  1640    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.515437  normal  0.451772 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0311  hypothetical protein  33.21 
 
 
1063 aa  394  1e-108  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.427486  decreased coverage  0.00324581 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2438  hypothetical protein  37.72 
 
 
562 aa  303  2e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2435  hypothetical protein  44.71 
 
 
689 aa  199  6e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1379  hypothetical protein  28.13 
 
 
649 aa  109  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.254687  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1515  hypothetical protein  25.17 
 
 
1580 aa  79.7  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3254  hypothetical protein  24.19 
 
 
2118 aa  75.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.55976  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0406  hypothetical protein  32.23 
 
 
2418 aa  67.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00205563 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5943  conserved repeat domain protein  30.73 
 
 
2434 aa  67  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4948  hypothetical protein  24.39 
 
 
1278 aa  63.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  33.33 
 
 
3911 aa  49.3  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>