14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2088 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2088  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 323 aa  622  1e-177  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0432  hypothetical protein  35.56 
 
 		 1002 aa  66.2  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.259517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  29.59 
 
 		 857 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1932  hypothetical protein  31.43 
 
 		 604 aa  62.4  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  37.1 
 
 		 646 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1905  hypothetical protein  31.82 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432179 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  37.5 
 
 		 536 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2855  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.97 
 
 		 726 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  36.96 
 
 		 882 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  37.31 
 
 		 2042 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  34.06 
 
 		 1695 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  30.77 
 
 		 12684 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3471  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  34.92 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.67703 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3736  hypothetical protein  26.99 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.127949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>