More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0638 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
878 aa  1790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2539  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.49 
 
 
452 aa  258  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815252 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.06 
 
 
453 aa  235  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00263259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8172  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  39.46 
 
 
660 aa  220  8.999999999999998e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8170  hypothetical protein  35 
 
 
648 aa  207  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.63 
 
 
726 aa  164  8.000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  32.78 
 
 
826 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1449  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.65 
 
 
446 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  34.38 
 
 
1315 aa  120  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2599  hypothetical protein  31.49 
 
 
726 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.03 
 
 
1060 aa  113  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  28.49 
 
 
399 aa  112  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  34.09 
 
 
339 aa  109  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.59 
 
 
1106 aa  106  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  30.39 
 
 
891 aa  105  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.17 
 
 
533 aa  105  5e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.17 
 
 
1078 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11414  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
377 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.37 
 
 
1172 aa  102  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
415 aa  102  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0039  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.66 
 
 
519 aa  101  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1559  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.45 
 
 
514 aa  101  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.05 
 
 
1239 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  33.55 
 
 
663 aa  100  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6701  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.56 
 
 
558 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4894  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.4 
 
 
1324 aa  100  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.570577  normal  0.462175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  27.6 
 
 
644 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.69 
 
 
370 aa  99.8  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1522  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.91 
 
 
402 aa  98.2  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.858341  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
495 aa  97.8  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.89 
 
 
483 aa  97.8  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
678 aa  97.4  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1816  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 
403 aa  97.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.176221  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.04 
 
 
630 aa  96.3  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0978  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.49 
 
 
514 aa  96.3  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000974435  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2666  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.77 
 
 
731 aa  96.7  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.785102  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  26.75 
 
 
307 aa  95.5  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.56 
 
 
490 aa  95.1  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
500 aa  94.7  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0073  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.87 
 
 
402 aa  94.7  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
597 aa  94.4  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 
966 aa  94.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.49 
 
 
629 aa  94.4  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1628  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.04 
 
 
1215 aa  93.6  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.279329 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.67 
 
 
629 aa  93.6  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  29.58 
 
 
560 aa  93.6  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.49 
 
 
629 aa  94  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0312  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.87 
 
 
484 aa  93.2  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2247  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.72 
 
 
536 aa  92.8  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2341  alkaline serine protease  30.67 
 
 
535 aa  93.6  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00532226  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.22 
 
 
629 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.58 
 
 
487 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2868  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.32 
 
 
540 aa  92  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.93 
 
 
771 aa  91.7  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.54 
 
 
639 aa  91.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.84 
 
 
596 aa  91.3  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.98 
 
 
641 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  31.88 
 
 
485 aa  90.9  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
423 aa  90.9  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1087  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
466 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.471806  normal  0.498219 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
392 aa  89.4  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0509  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.93 
 
 
412 aa  89.4  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00169266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.27 
 
 
1230 aa  89.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  28.89 
 
 
489 aa  89  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  32.57 
 
 
641 aa  88.6  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  29.41 
 
 
534 aa  88.6  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0026  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.42 
 
 
823 aa  88.6  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  32.34 
 
 
801 aa  88.6  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.92 
 
 
1361 aa  88.6  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2054  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
407 aa  88.2  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.390649  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21910  subtilisin-like serine protease  29.37 
 
 
586 aa  88.2  6e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.164253  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2875  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.45 
 
 
651 aa  88.2  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.311143  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10030  hypothetical serine protease (Eurofung)  25.99 
 
 
477 aa  87.8  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.632842  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1371  serine protease  28.82 
 
 
1121 aa  87.8  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0044  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.9 
 
 
518 aa  87.4  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.23 
 
 
601 aa  87.8  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  87.4  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.81 
 
 
1451 aa  87  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  87  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.99 
 
 
426 aa  87.4  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  30.06 
 
 
454 aa  87.4  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4308  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.18 
 
 
380 aa  86.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  28.57 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0373  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.05 
 
 
479 aa  86.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.443347 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
710 aa  86.3  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.11 
 
 
579 aa  86.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00110  extracellular alkaline serine protease  30.82 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.630326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1710  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.1 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30600  subtilisin-like serine protease  34.91 
 
 
524 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.68 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
1453 aa  85.5  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  31.65 
 
 
1333 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  29.02 
 
 
1285 aa  85.1  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.82 
 
 
391 aa  85.1  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.352881  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.06 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2861  serine metalloprotease  31.51 
 
 
497 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0448584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>