44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0188 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  100 
 
 		 891 aa  1789    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  56.83 
 
 		 813 aa  241  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  41.94 
 
 		 1879 aa  87.8  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.86 
 
 		 692 aa  84  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  48.84 
 
 		 1232 aa  78.6  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  42.45 
 
 		 4978 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  46.08 
 
 		 1129 aa  76.6  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  45.71 
 
 		 1672 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.66 
 
 		 1272 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.51 
 
 		 1673 aa  75.1  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  48.15 
 
 		 3911 aa  73.6  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.15 
 
 		 878 aa  68.2  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  37.16 
 
 		 1544 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  40.59 
 
 		 1626 aa  65.1  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.41 
 
 		 1394 aa  64.7  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  40.66 
 
 		 2375 aa  62.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  39.56 
 
 		 618 aa  58.5  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  40.2 
 
 		 1030 aa  57.4  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  52.78 
 
 		 1222 aa  57.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  31.17 
 
 		 2807 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  38.53 
 
 		 2411 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  38.53 
 
 		 2367 aa  55.5  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  31.79 
 
 		 968 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  35.07 
 
 		 1976 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3440  glycoside hydrolase family 8 protein  30.05 
 
 		 2772 aa  53.1  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.29 
 
 		 962 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  42.86 
 
 		 1170 aa  52.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  39.83 
 
 		 976 aa  52  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  41.38 
 
 		 1331 aa  51.6  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1648  hypothetical protein  36.36 
 
 		 707 aa  51.2  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255436  normal  0.0205712 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  34.59 
 
 		 2421 aa  51.2  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  35.43 
 
 		 2416 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  31.52 
 
 		 1123 aa  50.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.73 
 
 		 815 aa  49.7  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0172  hypothetical protein  43.04 
 
 		 398 aa  49.7  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.72 
 
 		 471 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  45.95 
 
 		 3542 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1251  hypothetical protein  34.21 
 
 		 1259 aa  46.2  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  44.29 
 
 		 2802 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  30.68 
 
 		 311 aa  45.4  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  33.94 
 
 		 3222 aa  45.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3185  hypothetical protein  26.73 
 
 		 2418 aa  45.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0865533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  34.86 
 
 		 2454 aa  45.4  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.26 
 
 		 3563 aa  45.1  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>