16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1964 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 573 aa  1103    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.408658  normal  0.421281 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1961  hypothetical protein  89.32 
 
 		 269 aa  389  1e-107  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00021169  normal  0.475569 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1960  hypothetical protein  71.62 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000119339  normal  0.362131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1963  hypothetical protein  67.84 
 
 		 456 aa  216  9e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0643426  normal  0.380201 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1851  pentapeptide repeat-containing protein  57.25 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000406154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2957  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  40.34 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1904  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.13 
 
 		 548 aa  59.3  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  27.37 
 
 		 620 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9181  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  29 
 
 		 531 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  39.62 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2021  hypothetical protein  30.34 
 
 		 296 aa  50.4  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000885135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001969  hypothetical protein  30.61 
 
 		 773 aa  49.7  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  27.18 
 
 		 5526 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10310  PPE family protein  30.51 
 
 		 3166 aa  47.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.395007 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1337  hypothetical protein  35.79 
 
 		 395 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.486068  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2398  hypothetical protein  26.5 
 
 		 325 aa  43.9  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.675927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>